[发明专利]一种鉴定大围山微型鸡品种的分子标记组合及其应用

权利要求书

1.一种鉴定大围山微型鸡品种的SNP位点组合，其特征在于，包括下表所示的SNP位点：

。

2.一种鉴定大围山微型鸡品种的分子标记组合，其特征在于，所述分子标记组合包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1-10所示的分子标记；

SEQ ID NO.1所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP1，为A/G突变；

SEQ ID NO.2所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP2，为T/C突变；

SEQ ID NO.3所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP3，为T/C突变；

SEQ ID NO.4所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP4，为T/C突变；

SEQ ID NO.5所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP5，为C/T突变；

SEQ ID NO.6所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP6，为G/A突变；

SEQ ID NO.7所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP7，为G/A突变；

SEQ ID NO.8所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP8，为C/T突变；

SEQ ID NO.9所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP9，为C/G突变；

SEQ ID NO.10所示分子标记的11bp处碱基存在突变位点SNP10，为C/T突变。

3.根据权利要求2所述的分子标记组合，其特征在于，所述SNP1的基因型为AA、AG或GG；所述SNP2的基因型为TT、TC或CC；所述SNP3的基因型为TT、TC或CC；所述SNP4的基因型为TT、TC或CC；所述SNP5的基因型为CC、CT或TT；所述SNP6的基因型为GG、GA或AA；所述SNP7的基因型为GG、GA或AA；所述SNP8的基因型为CC、CT或TT；所述SNP9的基因型为CC、CG或GG；所述SNP10的基因型为CC、CT或TT。

4.一种鉴定大围山微型鸡品种的引物对组合，其特征在于，所述引物对组合包括如下表所示的引物对1-10：

5.一种如权利要求1所述的SNP位点组合、如权利要求2或3所述的分子标记组合或如权利要求4所述的引物对组合在鉴定大围山微型鸡品种中的应用。

6.一种如权利要求4所述的引物对组合在制备大围山微型鸡品种鉴定试剂盒中的应用。

7.一种大围山微型鸡品种鉴定试剂盒，其特征在于，包括权利要求4所述的引物对组合。

8.一种鉴定大围山微型鸡品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)获取待测鸡个体的全基因组DNA，以所述全基因组DNA为模板，PCR扩增得到含有权利要求1所述的SNP位点组合的基因片段组合；

(2)对所述基因片段组合进行测序，鉴定出权利要求1所述的SNP位点组合中各SNP位点的基因型；

(3)根据步骤(2)鉴定得到的基因型，以下列公式计算血缘评价总得分S：

其中，Ai为SNPi对应基因型的最终权重；i为大于0且小于11的整数；

所述Ai的值根据下表得出：

(4)当所述血缘评价总得分S50时，所述待测鸡个体为大围山微型鸡。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中，所述PCR扩增采用如权利要求4所述的引物对组合。

10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中，所述PCR扩增的反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性40s，58℃退火温度40s，72℃延伸40s，35个循环；最后72℃延伸10min。