[发明专利]一种用于对有毒蘑菇进行种鉴定的引物组和PCR检测方法在审
申请号: | 202310191890.8 | 申请日: | 2023-02-27 |
公开(公告)号: | CN116179752A | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
发明(设计)人: | 张玉;姜帆;何佳遥;刘琛;朱水芳 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京百欧知识产权代理事务所(普通合伙) 11930 | 代理人: | 邹晓艳 |
地址: | 100176 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 有毒 蘑菇 进行 鉴定 引物 pcr 检测 方法 | ||
1.一种用于对有毒蘑菇进行种鉴定的引物组,其特征在于:包括用于对有毒蘑菇进行PCR分子鉴定的特异性引物组,所述有毒蘑菇包括选自爪哇鹅膏菌、异味鹅膏、肉褐鳞环柄菇、栎裸柄伞中的一种或多种;
所述有毒蘑菇对应的特异性引物如下表所列:
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于:还包括用于实时荧光PCR的特异性TaqMan探针,每种有毒蘑菇对应的TaqMan探针如下表所示:
。
3.一种用于对有毒蘑菇进行种鉴定的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所述的引物组,和PCR扩增反应所需的试剂;优选所述PCR为常规PCR或者实时荧光PCR或者数字PCR;优选所述PCR扩增反应所需的试剂为DNA聚合酶和DNA聚合酶缓冲液。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:还包括DNA提取试剂、阳性对照和阴性对照。
5.一种鉴定有毒蘑菇的常规PCR方法,其特征在于,所述有毒蘑菇包括选自爪哇鹅膏菌、异味鹅膏、栎裸柄伞、肉褐鳞环柄菇中的一种或多种;
包括如下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)采用权利要求1所述的引物组中的特异性引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增;
3)检测PCR扩增产物中是否含有目的扩增片段,含有对应目的扩增片段的样品鉴定为相应种类的有毒蘑菇;
爪哇鹅膏菌对应的扩增片段大小为410bp,
异味鹅膏对应的扩增片段大小为290bp,
栎裸柄伞对应的扩增片段大小为280bp,
肉褐鳞环柄菇对应的扩增片段大小为280bp。
6.根据权利要求5所述的常规PCR方法,其特征在于:
PCR反应体系为:总体积25μL,含有:2×Taq PCR Master mix 12.5μL,浓度均为10μM的上下游引物各1μL,DNA模板1μL,余量为ddH2O;
爪哇鹅膏菌PCR扩增程序为:94℃3min;94℃30s,60℃30s,72℃30s,30循环;72℃10min;
异味鹅膏PCR扩增程序为:94℃3min;94℃30s,65℃30s,72℃30s,30循环;72℃10min;
栎裸柄伞PCR扩增程序为:94℃3min;94℃30s,60℃30s,72℃30s,30循环;72℃10min;
肉褐鳞环柄菇PCR扩增程序为:94℃3min;94℃30s,60℃30s,72℃30s,30循环;72℃10min;
优选所述步骤3)中采用琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物中是否含有目的条带;
优选地,可检测的模板浓度可低至10-5ng/μl。
7.一种鉴定有毒蘑菇的实时荧光PCR方法,其特征在于,所述有毒蘑菇包括选自爪哇鹅膏菌、异味鹅膏、栎裸柄伞、肉褐鳞环柄菇中的一种或多种;
包括如下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)采用权利要求2所述的引物组对提取的基因组DNA进行实时荧光PCR扩增,根据扩增结果判断待测对象是否为对应种类的有毒蘑菇,如果Ct≤30则判断为对应种类的有毒蘑菇阳性。
8.根据权利要求7所述的实时荧光PCR方法,其特征在于:
所述实时荧光PCR的反应体系为:总体系20μL,含有2×Premix Ex Taq 10μl,浓度为10μmol/L的上下游引物各1μl,浓度为10μmol/L的探针0.5μl,ddH2O 6.5μl,DNA模板1μl;
其中,爪哇鹅膏菌、异味鹅膏、栎裸柄伞的qPCR扩增程序为:95℃10min;95℃10s,60℃40s,40个循环;
肉褐鳞环柄菇的qPCR扩增程序为:95℃10min;95℃10s,65℃40s,40个循环;
优选地,可检测的模板浓度可低至10-5ng/μl。
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