[发明专利]用于编辑植物中的组蛋白H3K4me3的SunTag系统、载体及编辑方法在审
| 申请号: | 202310105488.3 | 申请日: | 2023-02-13 |
| 公开(公告)号: | CN116284445A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
| 发明(设计)人: | 姜丹华;鲁井云;宋瑞甜;张怀仁 | 申请(专利权)人: | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
| 主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/113;C12N15/82;C07K14/415 |
| 代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 厉洋洋 |
| 地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 编辑 植物 中的 组蛋白 h3k4me3 suntag 系统 载体 方法 | ||
1.一种用于编辑植物中组蛋白H3K4me3的SunTag系统,其特征在于,所述SunTag系统包括连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶、连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白以及引导RNA;所述引导RNA可将所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶、所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白定位在待编辑的目标基因上;
其中,所述核酸内切酶为失活的Cas9、失活的Cas12、失活的Cas13、失活的Cas14中的一种,所述效应蛋白为ATX1蛋白的SET结构域、SDG2蛋白的SET结构域或ATXR7蛋白的SET结构域。
2.根据权利要求1所述一种用于编辑植物中组蛋白H3K4me3的SunTag系统,其特征在于,所述引导RNA包括四个RNA片段,分别为:如SEQ ID NO:10所示的guide RNA1、如SEQ IDNO:11所示的guide RNA2、如SEQ ID NO:12所示的guide RNA3以及如SEQ ID NO:13所示的guide RNA4。
3.根据权利要求2所述一种用于编辑植物中组蛋白H3K4me3的SunTag系统,其特征在于,所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶为dCas9-10×GCN4,所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白为scFv-sfGFP-ATX1 SET。
4.一种用于编辑植物中组蛋白H3K4me3的载体,其特征在于,所述载体采用如权利要求1-3任意一项所述的用于编辑组蛋白H3K4me3的SunTag系统构建而成。
5.一种如权利要求4所述的载体的构建方法,其特征在于,采用第一启动子、第二启动子、所述SunTag系统、筛选标记基因、入门载体以及终载体构建所述用于编辑组蛋白H3K4me3的载体;其中,所述第一启动子为两个,分别用于驱动所述连接有抗原蛋白GCN4的核酸内切酶和所述连接有抗体蛋白scFv的效应蛋白;所述第二启动子为用于驱动所述引导RNA的启动子。
6.根据权利要求5所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述第一启动子为如SEQ IDNO:1所示的pUBQ10;所述第二启动子包括如SEQ ID NO:7所示的AtU6-1、如SEQ ID NO:8所示的AtU6-29和如SEQ ID NO:9所示的AtU3d。
7.根据权利要求6所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述筛选标记基因为潮霉素抗性基因HygR。
8.根据权利要求7所述一种载体的构建方法,其特征在于,所述构建的方法为GreenGate,所述入门载体为pGGA、pGGB、pGGC、pGGD、pGGE和pGGF,所述终载体为pZ304;
构建步骤为:分别构建pGGA-AtU6-1:guide RNA1-AtU6-1:guide RNA2-AtU6-29:guideRNA3-AtU3d:guide RNA4、pGGB-dCas9-10×GCN4、pGGC-pUBQ10、pGGD-pUBQ10:scFv-sfGFP、pGGE-ATX1 SET以及pGGF-HygR的载体片段;
再将所述终载体与上述各载体片段依次连接,连接过程中,pGGA、pGGB、pGGC、pGGD、pGGE、pGGF被去除,得到所述用于编辑组蛋白H3K4me3的载体:pZ304-AtU6-1:guide RNA1-AtU6-1:guide RNA2-AtU6-29:guide RNA3-AtU3d:guide RNA4-pUBQ10:dCas9-10×GCN4-pUBQ10:scFv-sfGFP-ATX1 SET-HygR。
9.一种植物中组蛋白H3K4me3的编辑方法,其特征在于,采用权利要求4所述的载体进行编辑。
10.根据权利要求9所述一种植物中组蛋白H3K4me3的编辑方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、将所述载体转化根癌农杆菌,进行孵育、培养和阳性克隆筛选,得到农杆菌悬浮液;
S2、将盛花期的拟南芥植株花头浸入所述农杆菌悬浮液中1-2分钟,再将植株置于黑暗的湿盒中放置20小时,取出并放置在光下培养3-4周,收,第一代种子T1;
S3、将所述第一代种子T1进行消毒和风干后,撒在含有筛选培养基的1/2MS培养基上进行筛选,生长并且表现出早花表型的植株为组蛋白H3K4me3被编辑的转基因T1代植株;所述早花表型为,相对于野生型拟南芥,开花时间提前1周。
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