[发明专利]LncRNA-ENST00000446135在制备预测AML预后试剂盒中的应用在审

专利信息
申请号: 202211743017.7 申请日: 2022-12-30
公开(公告)号: CN116103400A 公开(公告)日: 2023-05-12
发明(设计)人: 王彩霞 申请(专利权)人: 广州市第一人民医院(广州消化疾病中心;广州医科大学附属市一人民医院;华南理工大学附属第二医院)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 周全英
地址: 510180 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: lncrna enst00000446135 制备 预测 aml 预后 试剂盒 中的 应用
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体涉及LncRNA‑ENST00000446135在制备预测AML预后试剂盒中的应用。本发明首次发现AML患者骨髓中LncRNA‑ENST00000446135的表达水平与AML患者的预后相关,当其表达水平CT值≥0.655时,指示AML患者预后良好;当其表达水平CT值0.655时,指示AML患者预后不良。本发明试剂盒对AML患者的预后预测效果较好,具有广阔的临床应用前景。

技术领域

本发明属于生物技术领域,具体涉及LncRNA-ENST00000446135在制备预测AML预后试剂盒中的应用。

背景技术

急性髓性白血病(AML)是一组具有各种遗传异常的造血系统恶性肿瘤,包括染色体易位和/或体细胞突变,其主要造成骨髓祖细胞的异常增殖、分化或存活。尽管多种治疗方法如化疗和干细胞移植等常用于AML的治疗,但其预后仍不容乐观,尤其是化疗耐药、转移及复发的产生对预后不良产生不容忽视的重要作用。目前多项研究表明,表观遗传失调对AML的作用越来越受重视,除了乙酰化及甲基化修饰,非编码RNA的调节也发挥重要作用。

已有研究表明,LncRNA在分子遗传水平和细胞水平具有相应的功能,包括参与基因组印记、剂量补偿效应、染色质的修饰、细胞分化、细胞周期的调控、细胞内物质的运输以及热休克反应等。如HOXA-AS2在体外和体内能够促进ADR细胞增殖并抑制细胞凋亡导致AML的发生,同时其能负调节ADR细胞中miR-520c-3p的表达来增强AML的化疗药物耐药。LncRNAANRIL通过AdipoR1/AMPK/SIRT1的葡萄糖代谢途径促进恶性细胞存活和细胞葡萄糖代谢以加速AML进展,其可作为AML治疗中潜在的预后标志物和治疗靶标。然而目前用于AML预后预测的标志物对AML预后指示的准确度不高,因此,开发一种具有更优指示AML预后的标志物对于AML更准确的预后具有重要意义。

发明内容

针对现有技术存在的问题,本发明目的在于提供LncRNA-ENST00000446135在制备预测AML预后试剂盒中的应用,本发明以LncRNA-ENST00000446135作为AML预后预测标志物,对于AML的预后预测具有较高的准确度。

基于上述目的,本发明采用的技术方案如下:

第一方面,本发明提供LncRNA-ENST00000446135在制备急性髓性白血病预后预测试剂盒中的应用。

LncRNA-ENST00000446135的核苷序列如SEQ ID NO.1所示,本发明通过对正常细胞和AML细胞的RNA-seq的差异性分析发现在AML细胞中LncRNA-ENST00000446135的表达水平显著低于正常细胞,并且在AML患者的标本中得到验证,LncRNA-ENST00000446135在AML初诊及复发患者中异常低表达,但在化疗缓解及造血干细胞移植后该LncRNA能恢复正常表达,表明LncRNA-ENST00000446135是AML患者生存时间的独立影响因素,因此,LncRNA-ENST00000446135可作为AML患者预后预测标志物。

优选地,通过检测临床患者的骨髓中LncRNA-ENST00000446135的表达水平,结合判定标准,从而预测AML预后。

优选地,上述判定标准如下:

当LncRNA-ENST00000446135的表达水平CT值≥0.655时,指示AML患者预后良好;

当LncRNA-ENST0000044613的表达水平CT值0.655时,指示AML患者预后不良。

基于本发明判定标准,能够更为准确指示AML患者的预后。

第二方面,本发明提供一种用于急性髓性白血病预后预测试剂盒,所述试剂盒包括用于扩增LncRNA-ENST00000446135的引物;所述引物如下:

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