[发明专利]一种分子环构象的生成方法、装置、电子设备和存储介质在审
| 申请号: | 202211727835.8 | 申请日: | 2022-12-30 |
| 公开(公告)号: | CN116130021A | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
| 发明(设计)人: | 王冰;周云飞;孙广旭 | 申请(专利权)人: | 深圳晶泰科技有限公司 |
| 主分类号: | G16C20/40 | 分类号: | G16C20/40;G16C20/50 |
| 代理公司: | 深圳市威世博知识产权代理事务所(普通合伙) 44280 | 代理人: | 泉雨昕 |
| 地址: | 518000 广东省深圳市福田区福*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 子环 构象 生成 方法 装置 电子设备 存储 介质 | ||
1.一种分子环构象的生成方法,其特征在于,包括:
获取目标分子的分子信息;
根据所述分子信息,从所述目标分子中提取相应的柔性环,并按照预设规则对所述柔性环进行处理,以得到所述目标分子对应的初始环构象集合;
对所述初始环构象集合进行优化,以获得所述目标分子对应的目标环构象集合。
2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述柔性环包括N个原子,将所述柔性环转换为以N个原子为顶点的平面N边形,且每个顶点具有初始空间坐标,其中N为大于或等于4的正整数。
3.根据权利要求2所述方法,其特征在于,所述按照预设规则对所述柔性环进行处理,以得到所述目标分子对应的初始环构象集合,包括:
将所述平面N边形划分成多个三角形层,其中,所述多个三角形层中每个三角形层包括至少一个三角形;
依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合;
利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,构建所述目标分子对应的初始环构象集合。
4.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,构建所述目标分子对应的初始环构象集合,包括:
依据所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,获得所述目标分子中与所述柔性环中N个原子相邻的非环原子的空间坐标;
利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合和所述非环原子的空间坐标,构建所述目标分子对应的初始环构象集合。
5.根据权利要求3所述方法,其特征在于,将所述平面N边形划分成多个三角形层包括:
以相邻的三个顶点为一组,对所述平面N边形执行i次划分操作,以使得每次划分操作得到至少一个三角形层,其中,i为大于或等于1的正整数,所述i次划分操作中相邻两次划分操作中的后一次划分操作是对前一次划分操作所得到的三角形层之外的平面区域进行划分,所述i次划分操作中最后一次划分操作后所剩余的三角形层中包括一个三角形。
6.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述多个三角形层包括第i三角形层和第i+1三角形层,其中所述第i三角形层和第i+1三角形层是执行相邻两次划分操作所得到的三角形层,i为大于或等于1的正整数;
所述依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合包括:
保持所述第i+1三角形层的顶点坐标为相应的初始空间坐标,按照预设的二面角取值列表改变第i三角形层与所述第i+1三角形层之间的二面角,以获得所述第i三角形层中除了具有初始空间坐标的顶点之外的各顶点坐标,从而得到所述柔性环中N个原子的空间坐标组合。
7.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,包括:
保持所述多个三角形层中任意一个三角形层的顶点坐标为相应的初始空间坐标;
按照预设的二面角取值列表改变所述任意一个三角形层与所述任意一个三角形层相邻的三角形层之间的二面角,以获得所述任意一个三角形层相邻的三角形层中除了具有初始空间坐标的顶点之外的各顶点坐标,从而得到所述柔性环中N个原子的空间坐标组合。
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