[发明专利]一种分子环构象的生成方法、装置、电子设备和存储介质在审

专利信息
申请号: 202211727835.8 申请日: 2022-12-30
公开(公告)号: CN116130021A 公开(公告)日: 2023-05-16
发明(设计)人: 王冰;周云飞;孙广旭 申请(专利权)人: 深圳晶泰科技有限公司
主分类号: G16C20/40 分类号: G16C20/40;G16C20/50
代理公司: 深圳市威世博知识产权代理事务所(普通合伙) 44280 代理人: 泉雨昕
地址: 518000 广东省深圳市福田区福*** 国省代码: 广东;44
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 子环 构象 生成 方法 装置 电子设备 存储 介质
【权利要求书】:

1.一种分子环构象的生成方法,其特征在于,包括:

获取目标分子的分子信息;

根据所述分子信息,从所述目标分子中提取相应的柔性环,并按照预设规则对所述柔性环进行处理,以得到所述目标分子对应的初始环构象集合;

对所述初始环构象集合进行优化,以获得所述目标分子对应的目标环构象集合。

2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述柔性环包括N个原子,将所述柔性环转换为以N个原子为顶点的平面N边形,且每个顶点具有初始空间坐标,其中N为大于或等于4的正整数。

3.根据权利要求2所述方法,其特征在于,所述按照预设规则对所述柔性环进行处理,以得到所述目标分子对应的初始环构象集合,包括:

将所述平面N边形划分成多个三角形层,其中,所述多个三角形层中每个三角形层包括至少一个三角形;

依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合;

利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,构建所述目标分子对应的初始环构象集合。

4.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,构建所述目标分子对应的初始环构象集合,包括:

依据所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,获得所述目标分子中与所述柔性环中N个原子相邻的非环原子的空间坐标;

利用所述柔性环中N个原子的空间坐标组合和所述非环原子的空间坐标,构建所述目标分子对应的初始环构象集合。

5.根据权利要求3所述方法,其特征在于,将所述平面N边形划分成多个三角形层包括:

以相邻的三个顶点为一组,对所述平面N边形执行i次划分操作,以使得每次划分操作得到至少一个三角形层,其中,i为大于或等于1的正整数,所述i次划分操作中相邻两次划分操作中的后一次划分操作是对前一次划分操作所得到的三角形层之外的平面区域进行划分,所述i次划分操作中最后一次划分操作后所剩余的三角形层中包括一个三角形。

6.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述多个三角形层包括第i三角形层和第i+1三角形层,其中所述第i三角形层和第i+1三角形层是执行相邻两次划分操作所得到的三角形层,i为大于或等于1的正整数;

所述依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合包括:

保持所述第i+1三角形层的顶点坐标为相应的初始空间坐标,按照预设的二面角取值列表改变第i三角形层与所述第i+1三角形层之间的二面角,以获得所述第i三角形层中除了具有初始空间坐标的顶点之外的各顶点坐标,从而得到所述柔性环中N个原子的空间坐标组合。

7.根据权利要求3所述方法,其特征在于,所述依据所述平面N边形的顶点的初始空间坐标,通过改变所述多个三角形层中三角形间的二面角,获得所述柔性环中N个原子的空间坐标组合,包括:

保持所述多个三角形层中任意一个三角形层的顶点坐标为相应的初始空间坐标;

按照预设的二面角取值列表改变所述任意一个三角形层与所述任意一个三角形层相邻的三角形层之间的二面角,以获得所述任意一个三角形层相邻的三角形层中除了具有初始空间坐标的顶点之外的各顶点坐标,从而得到所述柔性环中N个原子的空间坐标组合。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳晶泰科技有限公司,未经深圳晶泰科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202211727835.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top