[发明专利]一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel及其应用

说明书

本发明提供了一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel及其应用，属于陆地棉育种技术领域。本发明提供的与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。利用本发明分子标记可以在棉花生长早期快速、高效、准确鉴定棉铃大小，提高陆地棉大铃品种的选择效率。

技术领域

本发明属于陆地棉育种技术领域，尤其涉及一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel及其应用。

背景技术

棉花是重要经济和油料作物，是纺织工业的主要原材料。棉花产量是由铃重(Bollweight,BW)、单株铃数(Numbersofperplant,NB)和衣分(Lint percentage,LP)三因素构成。其中，铃重作为棉花产量性状的重要构成因子，是决定棉花产量的重要因素。铃重是用单铃内籽棉的重量表示，即由棉铃内的种子重量和棉纤维的重量相加而成，铃重性状的选择需要通过室内考种确定，具有一定的滞后性，影响田间育种选择效率。而棉铃大小一定程度上可以直观反映铃重大小，因此，育种工作者常把棉铃大小作为田间考察的重要指标。如何快速、高效、准确鉴定棉铃大小需要通过目标性状的精细定位，寻找到与之紧密连锁的分子标记。然而目前有关与棉花棉铃大小(铃重)紧密连锁的分子标记未见报道，且目标性状基因克隆研究的报道较少，不能满足现代快速的分子标记辅助选择育种和分子聚合育种。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel，利用本发明分子标记可以在棉花生长早期快速、高效、准确鉴定棉铃大小，提高陆地棉大铃品种的选择效率。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel，所述InDel功能分子标记BW07-InDel的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。

本发明还提供了一种用于检测上述InDel功能分子标记BW07-InDel的引物对，所述引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的反向引物。

本发明还提供了一种用于检测陆地棉棉铃大小的试剂盒，所述试剂盒包括上述引物对_。

本发明还提供了上述InDel功能分子标记BW07-InDel或上述引物对或上述试剂盒在检测陆地棉棉铃大小中的应用。

本发明还提供了上述InDel功能分子标记BW07-InDel或上述引物对或上述试剂盒在棉花高产品种选育中的应用。

本发明还提供了上述InDel功能分子标记BW07-InDel或上述引物对或上述试剂盒在分子聚合育种中的应用。

本发明还提供了上述InDel功能分子标记BW07-InDel或上述引物对或上述试剂盒在陆地棉基因图位克隆中的应用。

本发明还提供了一种检测陆地棉棉铃大小的方法，包括如下步骤：以待测棉花DNA为模板，用上述引物对进行PCR扩增，得到扩增产物；根据扩增产物的长度判断待测棉花棉铃大小：当扩增产物的长度为1820bp时，则待测棉花的棉铃为小铃；当扩增产物的长度为975bp时，则待测棉花的棉铃为大铃。

优选的，所述PCR扩增的反应体系为：ddH₂O19μl，模板DNA2.0μl，2×PhantaFlashMasterMix25μl，10μM的正向引物2.0μl，10μM的反向引物2.0μl。

优选的，所述PCR扩增的反应程序为98℃预热30s；98℃变性10s，57℃退火10s，72℃延伸10s，循环30次；72℃延伸1min，4℃保存。

本发明的有益效果：