[发明专利]检测猴痘病毒的组合物、试剂盒、方法及其用途

说明书

本发明属于分子生物学检测领域，具体地，涉及检测猴痘病毒并分型的组合物、试剂盒、方法及其用途。本发明提供一种检测猴痘病毒并分型的组合物，与此同时，还提供了包括所述组合物的试剂盒，所述组合物的用途，以及用于检测猴痘病毒并分型的方法。使用本发明的组合物，能够以200拷贝/mL的灵敏度对猴痘病毒进行快速检测。同时在反应体系中实现猴痘病毒的检测和分型。使得不同猴痘分支能够得到区分，可以更有针对性的进行治疗和预防。本发明组合物能够进一步地增加靶标，在单管内检测更多的靶标，更大程度的避免出现假阴性的可能，提高了检测的准确度。

技术领域

本发明属于分子生物学检测领域，具体地，涉及检测猴痘病毒并分型的组合物、试剂盒、方法及其用途。

背景技术

猴痘是一种由猴痘病毒(Monkeypox virus，MPXV)感染所致的人兽共患病毒性疾病。

猴痘潜伏期5-21天，多为6-13天。发病早期出现寒战、发热，体温多在38.5℃以上，可伴头痛、嗜睡、乏力、背部疼痛和肌痛等症状。多数患者出现颈部、腋窝、腹股沟等部位淋巴结肿大。发病后1-3天出现皮疹。皮疹首先出现在面部，逐渐蔓延至四肢及其他部位，皮疹多呈离心性分布，面部和四肢皮疹较躯干更为多见，手心和脚掌均可出现皮疹，皮疹数量从数个到数千个不等；也可累及口腔黏膜、消化道、生殖器、结膜和角膜等。皮疹经历从斑疹、丘疹、疱疹、脓疱疹到结痂几个阶段的变化，疱疹和脓疱疹多为球形，直径约0.5-1厘米，质地较硬，可伴明显痒感和疼痛。从发病至结痂脱落约2-4周。结痂脱落后可遗留红斑或色素沉着，甚至瘢痕，瘢痕持续时间可长达数年。部分患者可出现并发症，包括皮损部位继发细菌感染、支气管肺炎、脑炎、角膜感染、脓毒症等。

猴痘为自限性疾病，大部分预后良好。严重病例常见于年幼儿童、免疫功能低下人群，预后与感染的病毒分支、病毒暴露程度、既往健康状况和并发症严重程度等有关。猴痘病毒有两个不同的遗传进化枝：分支I(前刚果盆地(中非)分支)、分支II(前西非分支)，分支II又分为分支IIa和分支IIb。分支II(前西非分支)病死率约3％，分支I(前刚果盆地(中非)分支)病死率约10％。可见，两种支系的致死性有明显差异。由于分支I(前刚果盆地(中非)分支)和分支II(前西非分支)这两种进化支病毒引起疾病的流行病学和临床特征均不相同，加强不同进化支病毒遗传学差异的特征研究，对分支I(前刚果盆地(中非)分支)和分支II(前西非分支)进行精准分型，对疾病的防控是十分必要的。

自2022年1月1日以来，世卫组织所有6个区域的110个会员国向世卫组织报告了猴痘病例。自2022年5月13日以来，这些病例中有很大一部分报告来自以前没有猴痘传播记录的国家。这是首次在与西非或中非地区没有直接或直接流行病学联系的国家报告病例和持续传播链。

目前，国内外对病毒感染的诊断方法，主要是血清学试验、病毒培养和PCR。其中，血清学试验、组织培养，具有灵敏度低、免疫交叉反应以及周期长等缺点。

因此，本领域需求一种灵敏度高的快速诊断猴痘病毒并对西非支系和刚果金支系进行分型的产品，以便应对突发的猴痘疫情。

发明内容

有鉴于此，第一方面，本发明提供一种检测猴痘病毒的组合物，所述组合物包括：

第一核酸组合物：

如SEQ ID NO:1～3所示的检测猴痘病毒通用上游引物、猴痘病毒通用下游引物、猴痘病毒通用探针；或者

如SEQ ID NO:4～6所示的检测猴痘病毒通用上游引物、猴痘病毒通用下游引物、猴痘病毒通用探针；

第二核酸组合物：

如SEQ ID NO:7～9所示的检测猴痘病毒西非分支上游引物、猴痘病毒西非分支下游引物、猴痘病毒西非分支探针；或者

如SEQ ID NO:10～12所示的检测猴痘病毒西非分支上游引物、猴痘病毒西非分支下游引物、猴痘病毒西非分支探针；以及