[发明专利]一种多重定量PCR检测真菌的方法以及试剂盒在审
| 申请号: | 202211639799.X | 申请日: | 2022-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN116121439A | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
| 发明(设计)人: | 邵阳;刘佳;赵忞超;那成龙;刘思思;崔月利;郭垚;蒋文;吴卫卫 | 申请(专利权)人: | 成都迪飞医学检验实验室有限公司;迪感医学科技(成都)有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6851;C12R1/68;C12R1/645 |
| 代理公司: | 南京新慧恒诚知识产权代理有限公司 32424 | 代理人: | 邓唯 |
| 地址: | 610222 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 多重 定量 pcr 检测 真菌 方法 以及 试剂盒 | ||
1.一种多重定量PCR检测真菌的试剂盒,其特征在于,其中包括有用于多重定量PCR反应对真菌进行检测的引物组合,所述的引物组合包括:
用于对烟曲霉进行进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.1-2所示;
用于对新型隐球菌进行进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.4-5所示;
用于对耶氏肺孢子菌进行烟曲霉进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ IDNO.7-8所示;
用于对进行微小根毛霉进行检测的正反向引物对,核苷酸序列如SEQ ID NO.10-11所示。
2.根据权利要求1所述的多重定量PCR检测真菌的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒中还包括分别对扩增产物进行报告的探针组合;所述的探针组合包括:
用于对烟曲霉扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
用于对新型隐球菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
用于对耶氏肺孢子菌扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
用于对微小根毛霉扩增产物进行报告的探针,核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
3.根据权利要求1所述的多重定量PCR检测真菌的试剂盒,其特征在于,所述探针的5’端修饰有报告基团,所述报告基团为FAM、HEX、ROX和Cy5;四种探针采用不同的报告基团修饰。
4.根据权利要求1所述的多重定量PCR检测真菌的试剂盒,其特征在于,所述探针的3’端修饰有淬灭基团,所述猝灭基团为BHQ1和BHQ2。
5.根据权利要求4所述的多重定量PCR检测真菌的试剂盒,其特征在于,SEQ ID NO.3所示核苷酸序列与SEQ ID NO.6所示核苷酸序列采用淬灭基团BHQ1修饰,SEQ ID NO.9所示核苷酸序列与SEQ ID NO.12所示核苷酸序列采用淬灭基团BHQ2修饰。
6.一种多重定量PCR检测真菌的方法,其特征在于,其采用上述的试剂盒进行多重定量PCR反应对烟曲霉、新型隐球菌、耶氏肺孢子菌和微小根毛霉进行鉴定。
7.根据权利要求6所述的多重定量PCR检测真菌的方法,其特征在于,所述的方法中,还包括对样本进行多重PCR反应的步骤。
8.根据权利要求6所述的多重定量PCR检测真菌的方法,其特征在于,所述的样本包括但不限于肺泡灌洗液、痰液、血液、脑脊液、心包积液、胸水、尿液、脓液、拭子和组织等。
9.根据权利要求6所述的多重定量PCR检测真菌的方法,其特征在于,多重定量PCR反应中的试剂包括:2×Hieff Universal TaqMan multiplex qPCR master mix 12.5μL,Primer Mix(10uM)的终浓度为0.2μM,Probe Mix(10uM)的终浓度为0.1μM,10ng/μL的DNA模板1μL,无酶水补充25μL。
10.根据权利要求6所述的多重定量PCR检测真菌的方法,其特征在于,所述多重定量PCR扩增的反应程序为95℃预变性5min;95℃变性15s;58.5℃退火30s;扩增40个循环;所述的方法中,如果FAM荧光修饰探针有明显的S型扩增曲线时,说明待检样本中存在烟曲霉;如果HEX荧光修饰探针有扩增曲线时,且满足Ct<40说明待检样本中存在新型隐球菌;如果ROX荧光修饰探针有明显的S型扩增曲线时,说明待检样本中存在耶氏肺孢子菌;如果Cy5荧光修饰探针有明显的S型扩增曲线时,说明待检样本中存在微小根毛霉。
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