[发明专利]一种HEL-S-283基因敲除人结肠癌HCT116细胞株的构建方法在审
申请号: | 202211421567.7 | 申请日: | 2022-11-14 |
公开(公告)号: | CN116083484A | 公开(公告)日: | 2023-05-09 |
发明(设计)人: | 李磊;陈慧;沈诗慧;施培林;关秋景 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/113;C12N15/12;C12N5/10 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 hel 283 基因 结肠癌 hct116 细胞株 构建 方法 | ||
1.一种HEL-S-283基因敲除人结肠癌HCT116细胞株的构建备方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)针对人结肠癌HCT116细胞HEL-S-283基因的编码序列,设计得到sgRNAs序列,包含sgRNA1和sgRNA2;
(2)将步骤(1)得到的sgRNAs克隆到CRISPR-V2载体上,获得CRISPR-V2-HEL-S-283-gRNA1和CRISPR-V2-HEL-S-283-gRNA2质粒;
(3)使用脂质体转染法,将所述步骤(2)中的CRISPR-V2-HEL-S-283-gRNA1和CRISPR-V2-HEL-S-283-gRNA2质粒共转入人结肠癌HCT116细胞株;
(4)将转染后的HCT116细胞株常规培养36-48小时;
(5)第一次筛选:对步骤(4)中培养后的细胞有限稀释法获得单克隆细胞,培养得到单克隆细胞株;
(6)第二次筛选:对步骤(5)中获得的单克隆细胞株有限稀释法获得单克隆细胞,继续培养得到HCT116 HEL-S-283-/-单克隆细胞株;
(7)提取HCT116 HEL-S-283-/-单克隆细胞株基因组DNA,PCR扩增sgRNA序列,分析扩增产物;无法扩增出理论长度片段的细胞株,即为HCT116 HEL-S-283-/-细胞株。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述sgRNAs的靶序列分别为:TCATGGTAGGATTGTGACAAAGG和AACCATGAAGTCATCTAGCAGGG。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,
步骤(3)中,所述转染中用到的转染试剂为LipofectamineTM3000;
和/或,步骤(5)和步骤(6)中所述的有限稀释法中的铺板细胞密度为0.3~0.5个细胞/孔;
和/或,步骤(5)中,所述的培养的时间为7~14天;
和/或,步骤(6)中,所述的培养时间为7天。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(7)中,所述PCR扩增引物序列为:
Primers for Region 1上游引物:GGGTATCTTGTGATGGAGATGTGG
Primers for Region 1下游引物:GCACTTCAGGTGGGGTACTT;
Primers for Region 2上游引物:TCCTCCTCTTCTCTCTCTTTCCA
Primers for Region 2下游引物:TGAGATGGAGTTTCGCTCTTGT;
Primers for Region 3上游引物:GGGTATCTTGTGATGGAGATGTGG
Primers for Region 3下游引物:TGAGATGGAGTTTCGCTCTTGT。
5.根据权利要求1-4之任一项所述的方法构建得到的HEL-S-283基因敲除人结肠癌HCT116细胞株。
6.sgRNA,其特征在于,所述sgRNA的靶序列如下:TCATGGTAGGATTGTGACAAAGG和AACCATGAAGTCATCTAGCAGGG。
7.根据权利要求6所述的sgRNA在构建HEL-S-283基因敲除人结肠癌HCT116细胞株中的应用。
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