[发明专利]威尼斯镰刀菌TB01的整合位点及其应用在审
申请号: | 202211384512.3 | 申请日: | 2022-11-07 |
公开(公告)号: | CN115786384A | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
发明(设计)人: | 马延和;童胜;李德茂;安可心;陈吴西;王钦宏;孙媛霞 | 申请(专利权)人: | 中国科学院天津工业生物技术研究所 |
主分类号: | C12N15/80 | 分类号: | C12N15/80;C12N15/65;C12N15/31;C12Q1/6897;G01N21/64;C12R1/77 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 | 代理人: | 靳雪华 |
地址: | 300308 *** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 威尼斯 镰刀 tb01 整合 及其 应用 | ||
1.威尼斯镰刀菌TB01的整合位点,其特征在于,包括两个配套CRISPR/Cas9系统使用的整合位点,其分别位于:威尼斯镰刀菌TB01的1号染色体FVRRES_00686基因上游5438bp处和威尼斯镰刀菌TB01的1号染色体FVRRES_00686基因上游4499bp处。
2.根据权利要求1所述的威尼斯镰刀菌TB01的整合位点,其特征在于,GFP表达盒在所述威尼斯镰刀菌TB01上的插入位点为1号染色体FVRRES_00686基因上游4886bp处。
3.包含权利要求2所述的威尼斯镰刀菌TB01的整合位点的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
4.向权利要求1所述的威尼斯镰刀菌TB01的整合位点定点插入不同启动子驱动下的GFP表达盒,其特征在于,含有用于GFP表达盒在威尼斯镰刀菌TB01定点插入所需的CRISPR/Cas9表达载体和供体DNA。
5.向权利要求4所述的威尼斯镰刀菌TB01的整合位点插入基因的方法,其特征在于,针对向威尼斯镰刀菌TB01整合位点定向插入靶基因,构建包含CRISPR/Cas9序列和sgRNA序列的表达载体及相应的供体DNA片段,将权利要求4中所述的载体和供体片段转化所述的威尼斯镰刀菌TB01。
6.威尼斯镰刀菌TB01的整合位点的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、通过原生质体转化法将GFP表达盒导入到威尼斯镰刀菌TB01中,获得GFP表达文库;
S2、从所述GFP表达文库中筛选出中性插入且能够高表达的荧光菌株;
S3、鉴定GFP表达盒在所述荧光菌株中的插入位点,其插入位点具体为1号染色体FVRRES_00686基因上游4886bp处;
S4、以步骤S3确定的插入位点为中心,选取其上下游各600bp区域作为候选序列,采用CRISPR/Cas9介导的基因同源定向重组插入;
S5、通过CRISPR/Cas9介导靶标基因对步骤S4中选取的候选序列进行整合效率、遗传稳定性、菌株生长评估后,确认威尼斯镰刀菌TB01的整合位点包括权利要求1所述的两个整合位点。
7.威尼斯镰刀菌TB01的整合位点在威尼斯镰刀菌TB01基因工程中的应用。
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