[发明专利]一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记及应用，属于分子生物学及遗传育种技术领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述分子标记存在1个SNP位点，位于如SEQ ID NO:1所示序列的183bp。本发明在猕猴桃中定位了与猕猴桃一年生枝粗度连锁的QTL，提供了一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL紧密连锁的分子标记。在常规育种方法中，猕猴桃树体生长性状在苗期很难判断，并且准确度和育种效率较低，通过检测上述与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记，即可预测猕猴桃植株的一年生枝粗度性状，进而进行早期筛选，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率。

技术领域

本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，特别是涉及一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记及应用。

背景技术

猕猴桃(Actinidia)为猕猴桃科(Actinidiaceae)猕猴桃属(Actinidia Lindl.)雌雄异株多年生藤本植物，共有54个种和21个变种，是20世纪野生果树人工驯化栽培最有成就的四大果树之一。品种是产业发展的“芯片”，猕猴桃的一年生枝粗度与树势强弱密切相关，是培育优良品种的基础，也是影响果实生长发育至关重要的因素。此外，树势强壮的植株其综合抗性较强，更便于后期管理，从而大大降低种植风险和投入成本。

猕猴桃育种方法从传统野生直接选种逐渐转向杂交育种，在杂交育种过程中，从杂交分离后代中挑选优良的重组基因型是其关键步骤。传统依靠表型选择的育种方法耗时费力并且难度大，培育一个新品种需花费10～15年时间，并且多数表型性状是易受环境影响的数量性状，表现不稳定，降低了选育的准确度。随着PCR技术和现代测序技术的发展，产生了分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)育种技术，由于该方法是基于基因型而不是表现型来选择育种目标的性状，受到广大育种学家及遗传学家的青睐。在育种工作中采用定向杂交育种与分子辅助育种相结合的方法，将分子标记与性状进行关联分析，从而快速筛选出具有特定优良性状的品种。标记辅助育种的关键是找到和表型连锁的标记，构建遗传连锁图谱(genetic linkage map)并进行数量性状位点(quantitativetrait locus，QTL)定位，可有效建立起标记与表型之间的连锁关系，是实施MAS的有效途径。

由于传统育种方法的局限性，难以在猕猴桃苗期进行选育，结合QTL定位区间信息，本发明开发出与一年生枝粗度QTL连锁的分子标记，此方法能提高育种效率，也为猕猴桃定植后的栽培管理和综合抗性提供有力保障。

发明内容

本发明的目的是提供一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，本发明通过发现染色体Group10上的SNP位点，并将其与猕猴桃的一年生枝粗度关联分析，为猕猴桃植株的早期筛选提供了有力保障。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与猕猴桃一年生枝粗度QTL连锁的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述分子标记存在1个SNP位点，位于如SEQ ID NO:1所示序列的183bp，所述SNP位点为A或C。

进一步的，所述SNP位点对应的基因型包括AA和AC。

进一步的，所述SNP位点的基因型为AA时，猕猴桃植株的一年生枝粗度大于AC基因型植株。

本发明还提供一种检测猕猴桃一年生枝粗度的方法，包括以下步骤：

(1)以待测猕猴桃的基因组DNA为模板，利用如SEQ ID NO:2-3所示的引物对PCR扩增得到扩增产物；

(2)对所述扩增产物测序，检测扩增产物基因序列第183bp的基因型，当基因型为AA时，猕猴桃植株的一年生枝粗度大于AC基因型植株。