[发明专利]一种辣椒全基因组SNP-Panel及其应用有效
| 申请号: | 202211269383.3 | 申请日: | 2022-10-18 |
| 公开(公告)号: | CN115679012B | 公开(公告)日: | 2023-07-04 |
| 发明(设计)人: | 张敏;黄树苹;张洪源;王本启;谈杰;陈霞 | 申请(专利权)人: | 武汉市农业科学院;武汉基诺赛克科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6806;C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 范冬冬 |
| 地址: | 430345 湖北省*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 辣椒 基因组 snp panel 及其 应用 | ||
1.一种辣椒全基因组SNP-Panel在建立辣椒DNA指纹数据库及遗传多样性分析中的应用,其特征在于,所述应用包括如下步骤:
利用表1所述550个SNP位点的引物对辣椒的基因组DNA进行混合PCR扩增,扩增产物经测序、分型获得辣椒在所述550个SNP位点上的的基因组数据,即构成辣椒的DNA指纹数据库;
根据所述辣椒的DNA指纹数据库信息建立聚类树状图,即可进行辣椒的遗传多样性分析;所述550个SNP位点信息及扩增引物序列如表1所示:
表1550个SNP位点及引物序列
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其中,表1中的染色体上的碱基位置是以公开的辣椒全基因组版本号Zunla-1v2.0作为参照。
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