[发明专利]细胞分割的图像处理方法、装置、计算机设备及存储介质在审
| 申请号: | 202211201558.7 | 申请日: | 2022-09-29 |
| 公开(公告)号: | CN115760861A | 公开(公告)日: | 2023-03-07 |
| 发明(设计)人: | 张宸源;彭昱榕;魏彩霞;彭德志;曾敬富;王丽媛 | 申请(专利权)人: | 昆明金域医学检验所有限公司 |
| 主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06T5/00;G06T3/40 |
| 代理公司: | 深圳市诺正鑫泽知识产权代理有限公司 44689 | 代理人: | 罗秦 |
| 地址: | 650200 云南省昆明市官渡区经开区洛羊街道办事处新加坡产*** | 国省代码: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 细胞 分割 图像 处理 方法 装置 计算机 设备 存储 介质 | ||
本申请提供了一种细胞分割的图像处理方法、装置、计算机设备及存储介质,通过对待处理的FISH图像进行超分辨率重构,得到了细胞图像边缘分辨率更高的标准FISH图像,同时基于腐蚀变换,消除标准FISH图像中的噪点,此外利用分水岭算法,对消除噪点的FISH图像进行细胞分割,得到分割的细胞图像,利用识别算法,对分割的细胞图像内的信号点进行识别并计数。相较于人工对FISH图像中细胞进行分割以及对信号点进行计数,本申请能大大提高细胞分割以及信号点计数的效率,也能避免因人工的主观因素导致的错误。
技术领域
本申请涉及医学图像处理技术领域,特别涉及为一种细胞分割的图像处理方法、装置、计算机设备及存储介质。
背景技术
荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)是20世纪80年代末在放射性原位杂交技术基础上发展起来的一种非放射性分子生物学和细胞遗传学结合的新技术,是以荧光标记取代同位素标记而形成的一种新的原位杂交方法,其利用荧光标记的特异核酸探针与细胞内相应的靶DNA分子或RNA分子杂交,通过在荧光显微镜或激光共聚焦扫描仪下观察荧光信号,来确定与特异探针杂交后被染色的细胞或细胞器的形态和分布,或者是结合了荧光探针的DNA区域或RNA分子在染色体或其他细胞器中的定位。
在FISH检测时,需要人工对FISH图像中的粘连细胞进行分割分析,同时也需要人工对细胞内的信号点进行计数。而人工分割计数存在分割、计数效率低,以及人工分割、计数时容易出错的问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种细胞分割的图像处理方法,能够解决上述人工分割计数存在分割、计数效率低,以及人工分割、计数时容易出错的问题。
为了实现上述发明目的,本发明提供如下技术方案:
第一方面,提供了一种细胞分割的图像处理方法,所述方法包括:
获取待处理FISH图像,所述待处理FISH图像由图像采集装置采集,所述待处理FISH图像中包括待分割细胞和位于待分割细胞内的信号点;
对待处理FISH图像进行超分辨率重构,对待分割细胞的细胞图像边缘进行重构加强,获取细胞图像边缘分辨率更高的标准FISH图像;
基于腐蚀变换,消除标准FISH图像中的噪点,获取消除噪点的FISH图像;
基于分水岭算法,对消除噪点的FISH图像进行细胞分割,所述细胞分割基于待分割细胞的细胞图像边缘进行识别,获取分割的细胞图像;
基于识别算法,对分割的细胞图像内的信号点进行识别并计数。
第二方面,提供了一种致病病原体的预测装置,包括:
获取模块,用于获取待处理FISH图像,所述待处理FISH图像由图像采集装置采集,所述待处理FISH图像中包括待分割细胞和位于待分割细胞内的信号点;
重构模块,用于对待处理FISH图像进行超分辨率重构,对待分割细胞的细胞图像边缘进行重构加强,获取细胞图像边缘分辨率更高的标准FISH图像;
消除模块,用于基于腐蚀变换,消除标准FISH图像中的噪点,获取消除噪点的FISH图像;
分割模块,用于基于分水岭算法,对消除噪点的FISH图像进行细胞分割,所述细胞分割基于待分割细胞的细胞图像边缘进行识别,获取分割的细胞图像;
识别模块,用于基于识别算法,对分割的细胞图像内的信号点进行识别并计数。
第三方面,提供了一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,所述计算机程序被所述处理器执行时,使得所述处理器执行以下步骤:
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