[发明专利]分子表示方法及电子设备在审
申请号: | 202211150982.3 | 申请日: | 2022-09-21 |
公开(公告)号: | CN115512789A | 公开(公告)日: | 2022-12-23 |
发明(设计)人: | 王逸群;沈宇宁;汪励颢;陈实 | 申请(专利权)人: | 北京有竹居网络技术有限公司;脸萌有限公司 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50;G16C20/70 |
代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 邓雪萌 |
地址: | 101299 北京市平*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 表示 方法 电子设备 | ||
1.一种分子表示方法,包括:
确定分子的分子表面,所述分子表面为连续的黎曼流形且所述分子表面包括离散的多个表面节点;
基于所述分子表面,确定所述分子的几何特征;
通过将所述分子内部的原子信息映射到所述多个表面节点,确定所述分子的化学特征;
通过将所述几何特征与所述化学特征进行整合,确定所述分子的统一特征;以及
通过使用含时演化神经网络模型,基于所述统一特征确定所述分子的含时演化多尺度特征。
2.根据权利要求1所述的方法,其中确定分子表面包括:
基于所述分子的电子密度场的等值面,确定所述分子表面;或者
基于所述分子的溶剂可及表面或不可及表面的采样,确定所述分子表面。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述几何特征包括热核特征函数和/或波核特征函数,并且其中确定几何特征包括:
确定所述分子表面的拉普拉斯算符的本征函数和本征值;
基于所述本征函数和所述本征值,确定所述热核特征函数;和/或
基于所述本征函数和所述本征值,确定所述波核特征函数。
4.根据权利要求1所述的方法,其中确定几何特征包括:
确定所述分子表面的高斯曲率和/或平均曲率,并且所述几何特征包括所述高斯曲率和/或所述平均曲率。
5.根据权利要求1所述的方法,其中确定化学特征包括:
针对所述多个表面节点中每个节点,通过将与所述节点关联的多个原子的原子信息映射到所述节点,得到所述节点的化学环境特征;
基于所述多个表面节点中每个节点的化学环境特征,使用全连接神经网络,确定所述化学特征。
6.根据权利要求5所述的方法,其中与所述节点关联的多个原子包括:
与所述节点之间的距离低于距离阈值的范围内的多个原子;或者
与所述节点最邻近的固定数量的多个原子。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述含时演化神经网络模型包括演化算符,所述演化算符基于以下至少一项被确定:
黎曼流形上拉普拉斯算符的本征函数、或
表面势能项。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述表面势能项为用户设定的在黎曼流形上的函数分布。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,所述分子为镜像对称分子,所述方法还包括:
基于所述含时演化多尺度特征在所述黎曼流形上的方向梯度,确定所述镜像对称分子的手性。
10.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,所述分子包括蛋白质分子,所述方法还包括:
基于所述含时演化多尺度特征,确定所述分子表面的所述多个表面节点中的至少一个节点,所述至少一个节点指示与病毒进行结合的位点。
11.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,还包括:
获取所述分子表面的目标区域;
基于所述含时演化多尺度特征,确定与所述分子表面的目标区域对应的区域含时演化多尺度特征;
基于所述区域含时演化多尺度特征,从多种预定分子中确定与所述目标区域具有关联的至少一种预定分子。
12.根据权利要求1至8中任一项所述的方法,还包括:
基于所述含时演化多尺度特征,通过平均池化或最大池化确定所述分子的整体特征。
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