[发明专利]一种大豆低聚糖相关的KASP标记及其应用

说明书

本发明提供了一种大豆低聚糖相关的KASP标记及其应用，属于分子育种技术领域，所述KASP标记包括S18_51868868T/G和S10_38081012T/C中的一种或两种，所述S18_51868868T/G为大豆基因组第18号染色体51868868bp位置上的碱基为T/G，所述S10_38081012T/C为大豆基因组第10号染色体38081012bp位置上的碱基为T/C。本发明的KASP标记可准确对棉子糖和水苏糖含量性状进行基因分型，通过基因分型发现基因型为GG的大豆种质的棉子糖含量高于TT的棉子糖含量，基因型为TT的大豆种质的水苏糖含量高于CC的水苏糖含量，因此，本发明的KASP标记能够用于大豆高低聚糖含量种质的选育，且本发明的KASP标记进行早期育种的选择，减少大豆育种工作量，加快大豆育种进程具有重要意义。

技术领域

本发明属于分子育种技术领域，尤其涉及一种大豆低聚糖相关的KASP标记及其应用。

背景技术

大豆低聚糖是大豆子粒中可溶性糖类的总称，主要包括蔗糖、棉子糖、水苏糖。研究表明，低聚糖有很好的理化性质—安全无毒性、低甜度、热稳定性强等，并且，它有很重要的生理功能—防止腹泻、抗癌、保护肝脏功能等。因此，大豆低聚糖是一种保健食品，广泛应用于饮料、酸奶、水产制品、果酱、糕点和面包等食品中，具有广阔的市场。

虽然大豆低聚糖对人类健康和植物生长发育发挥着重要作用，但目前对大豆资源的利用程度较低，专用型大豆品种少，培育专用型大豆具有很好的发展前景。大豆低聚糖是典型的数量性状，受多基因控制，容易受到土壤环境，气候变化等外界环境因素的影响。在常规的筛选中，每个大豆种质的低聚糖都进行测定，存在鉴定周期长、成本高、费时费力的问题，不能满足稳定高效的筛选需求。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种大豆低聚糖相关的KASP标记及其应用。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种大豆低聚糖相关的KASP标记，所述KASP标记包括S18_51868868T/G和S10_38081012T/C中的一种或两种，所述S18_51868868T/G为大豆基因组第18号染色体51868868bp位置上的碱基为T/G，所述S10_38081012T/C为大豆基因组第10号染色体38081012bp位置上的碱基为T/C。

优选的，所述S18_51868868T/G处碱基是T的大豆为棉子糖含量低的大豆，碱基是G的大豆为棉子糖含量高的大豆。

优选的，所述S10_38081012T/C碱基是T的大豆为水苏糖含量高的大豆，碱基是C的大豆为水苏糖含量低的大豆。

本发明还提供了一种用于检测上述KASP标记的引物对，所述KASP标记的引物对包括S18_51868868T/G引物对和S10_38081012T/C引物对中的一种或两种；

所述S18_51868868T/G的上游引物F1的序列如SEQ ID No.1所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.2所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.3所示；

所述S10_38081012T/C的上游引物F1的序列如SEQ ID No.4所示，上游引物F2的序列如SEQ ID No.5所示，下游引物R的序列如SEQ ID No.6所示。

本发明还提供了一种用于检测上述KASP标记的试剂盒，所述试剂盒包含上述的引物对。

本发明还提供了一种上述KASP标记、引物对或试剂盒在提高大豆低聚糖种质育种中的应用。

本发明还提供了一种筛选高低聚糖含量大豆的方法，包括如下步骤：

以待测大豆基因组DNA为模板，利用上述的引物对分别进行PCR扩增反应，通过PCR扩增产物的荧光信号，进行基因分型。