[发明专利]一种基于距离信号输出的DNA糖基化酶即时检测方法在审
申请号: | 202211117518.4 | 申请日: | 2022-09-14 |
公开(公告)号: | CN115838779A | 公开(公告)日: | 2023-03-24 |
发明(设计)人: | 刘猛;薛伟;宋开鋆;常洋洋 | 申请(专利权)人: | 大连理工大学 |
主分类号: | C12Q1/34 | 分类号: | C12Q1/34;C12Q1/6844 |
代理公司: | 大连东方专利代理有限责任公司 21212 | 代理人: | 周媛媛;李馨 |
地址: | 116024 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 距离 信号 输出 dna 糖基化酶 即时 检测 方法 | ||
本发明公开了一种基于距离信号输出的DNA糖基化酶即时检测方法,属于分析检测领域。反应过程包括:(1)制备功能化DNA水凝胶;(2)水凝胶负载于纸分析器件纸片A的亲水区用以阻止缓冲液通过;(3)单功能DNA糖基化酶在人源脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE)协助下或者双功能DNA糖基化酶直接作用刺激水凝胶瓦解;(4)不同浓度DNA糖基化酶对水凝胶瓦解程度不同,使得在纸分析器件中穿过纸片A流速变化的缓冲液可以携带纸片B上的颜色指示剂在纸片C中产生不同距离的色柱实现对DNA糖基化酶的可视化检测。该方法具有简单、便携、低成本,无需大型仪器等分析性能,具有很好的应用前景。
技术领域
本发明属于分析检测领域,具体涉及一种基于距离信号输出的DNA糖基化酶即时检测方法。
背景技术
DNA复制是通过模板与互补链的沃森-克里克碱基配对(A:T和G:C)并依赖聚合酶催化磷酸二酯键的形成实现的。DNA产物的精准复制和序列的稳定保持对种族的延续至关重要。然而,DNA容易受到内源性或外源性化学物质的影响使得碱基发生损伤。DNA序列中胞嘧啶自发脱氨为尿嘧啶或在DNA复制过程中dUTP直接错误掺入在DNA上产生尿嘧啶是最具代表性的一种损伤。细胞已经进化出了碱基切除修复(BER)通路用以修复损伤的碱基。其中尿嘧啶可诱导尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)在人源脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE)的协助下识别和切除DNA上的尿嘧啶生成具有3'OH末端的DNA,并启动进一步的DNA修复过程。因此,UDG在维持DNA完整性和稳定性方面起到了非常重要的作用。UDG水平异常不仅可导致尿嘧啶诱导的BER通路失调还与人类免疫缺陷、淋巴瘤、神经退行性疾病等各种疾病密切相关。目前常用的检测UDG活性的方法有凝胶电泳法、比色法、光电化学法、荧光法等。然而,这些方法存在着费时费力、仪器复杂、灵敏度差、探针设计昂贵复杂、或需要标记信号分子等问题。因此,迫切需要开发一种简单、便携、低成本,无需大型仪器,可视化检测的UDG活性检测方法。
发明内容
本发明为解决现有的技术问题,借助对DNA糖基化酶响应的功能化DNA水凝胶和纸分析器件,构建了一种便携、简单、低成本、灵敏、无需大型仪器的UDG活性检测平台。为此,本发明采用的技术方案如下:
本发明提供了一种纸分析器件,包括纸片A、纸片B和纸片C;所述纸片A、纸片B和纸片C均包括亲水区和疏水区,所述纸片C包括相连接的中转区和显色区,所述中转区和所述显色区底部设有密封底衬;纸片A的亲水区、纸片B的亲水区与纸片C的中转区在垂直位置上相对应设置,纸片C的显色区不被纸片A和纸片B遮挡;
所述纸片A的亲水区上负载功能化DNA水凝胶,所述纸片B的亲水区上负载颜色指示剂。
进一步地,所述功能化DNA水凝胶包括DNA糖基化酶可识别剪切的损伤碱基以及任意含有A,G,C,T的DNA链。
进一步地,所述DNA糖基化酶包括尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)或人单链选择性单功能尿嘧啶DNA糖基化酶(hSMUG)。
进一步地,所述颜色指示剂包括溴酚蓝、甲基橙、甲基红或紫色石蕊。
进一步地,所述亲水区被所述疏水区包围;所述纸片C也设有疏水区,纸片C的疏水区包围中转区和显色区;所述显色区为长方形,根据长方形内色柱的长度对0-50U/mL浓度范围内DNA糖基化酶进行定量检测。
本发明还提供了一种基于距离信号输出的DNA糖基化酶即时检测方法,进一步地,包括如下步骤:
(1)功能化DNA水凝胶负载于纸分析器件纸片A的亲水区;颜色指示剂负载于纸分析器件纸片B的亲水区;组装所述纸分析器件;
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