[发明专利]一种快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法在审
| 申请号: | 202211045147.3 | 申请日: | 2022-08-30 |
| 公开(公告)号: | CN116064857A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
| 发明(设计)人: | 曹洋;汪大为;曾桢;张蕾;鹿阳;冯慧军;李淑华;廖秦平 | 申请(专利权)人: | 北京清华长庚医院 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6858;C12Q1/14;C12N15/11;C12R1/46 |
| 代理公司: | 天津协众信创知识产权代理事务所(普通合伙) 12230 | 代理人: | 刘斌 |
| 地址: | 102200 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 快速 检测 gbs 相关 基因 siglec14 及其 融合 突变 方法 | ||
1.一种快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:向同一管中添加三组引物及探针,连续进行PCR和qPCR两轮反应,其中,所述引物包括第一轮Siglec14/5融合突变基因的PCR扩增引物、第二轮靶向融合突变基因的qPCR检测引物和探针以及靶向野生型正常Siglec14与Siglec5基因之间非编码区序列的qPCR检测引物和探针;
其中,第一轮PCR引物Tm值高于第二轮qPCR引物Tm值,两轮PCR反应均分别经过高温变性和退火延伸的过程,且第一轮PCR的退火温度大于第二轮qPCR退火温度;
在第二轮qPCR中利用荧光信号的不同一次性对Siglec基因的野生型、突变型、杂合型进行有效区分。
2.根据权利要求1所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:Siglec-GAP-F-1、Siglec-GAP-R-1、Siglec-GAP-F-2或Siglec-GAP-R-2为正常Siglec基因之间非编码区序列的检测引物;Siglec-GAP-P-1或Siglec-GAP-P-2为正常Siglec基因之间非编码区序列的检测探针,仅在第二轮qPCR检测时进行反应;Siglec-L-F-1或Siglec-L-F-2靶向Siglec14基因启动子区域,为第一轮PCR上游扩增引物;Siglec-L-R-1或Siglec-L-R-2靶向Siglec5基因的下游编码区域,为第一轮PCR下游扩增引物;Siglec-S-F-1或Siglec-S-F-2为第二轮靶向融合突变基因的qPCR上游检测引物;Siglec-S-R-1、Siglec-S-R-2为第二轮靶向融合突变基因的qPCR下游检测引物;Siglec-S-P-1或Siglec-S-P-2为第二轮靶向融合突变基因的qPCR的检测探针。
3.根据权利要求2所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:探针可以是普通Taqman探针或相同序列的MGB探针,探针可以是FAM、VIC、CY5、ROX、SYTO-9通道中任意两种不同的标记。
4.根据权利要求1~3任一所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:PCR和qPCR两轮反应的步骤为:1)90~98℃预变性2~10min;2)启动第一轮PCR扩增反应,90~98℃变性5~30s;3)72~65℃退火并延伸60~200s,第一轮PCR反应共循环30~45次;4)启动第二轮qPCR检测反应,90~98℃5~30s;5)55~60℃退火并延伸30~60s,第二轮qPCR反应共循环30~45次,退火延伸过程收集信号。
5.根据权利要求4所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:PCR和qPCR两轮反应的步骤为:1)94℃预变性2min;2)启动第一轮PCR扩增反应,94℃变性5s;3)72℃退火并延伸120s,第一轮PCR反应共循环30次;4)启动第二轮qPCR检测反应,94℃变性5s;5)60℃退火并延伸30s,第二轮qPCR反应共循环45次,退火延伸过程收集信号。
6.根据权利要求4所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:PCR和qPCR两轮反应的步骤为:1)94℃下预变性2min;2)启动第一轮PCR扩增反应,98℃变性5s;3)72℃退火并延伸120s,第一轮PCR反应共循环30次;4)启动第二轮qPCR检测反应,98℃变性5s;5)60℃退火并延伸30s,第二轮qPCR反应共循环45次,退火延伸过程收集信号。
7.根据权利要求1所述的快速检测与GBS相关的易感基因Siglec14/5及其融合突变的方法,其特征在于:检测样本可采用阴道分泌物,血液,羊水,尿液,粪便。
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