[发明专利]一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物及其应用

权利要求书

1.一组用于预测头颈鳞癌预后的标志物，其特征在于：所述的标志物由如下16个与乳酸代谢相关的基因组成：PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10。

2.如权利要求1所述的标志物在构建用于预测头颈鳞癌预后的生存模型中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述的用于预测头颈鳞癌预后的生存模型的风险评分关系式为：

Risk score =PYGL*0.1536+DARS2*0.0340+YARS2*0.0468+DNAJC19*0.0889+ISCA1*0.0756+IRAK1*0.0685+SPP1*0.0208+SLC25A4*0.1961-FLI1*0.1677+TANGO2*0.0997+UQCRC2*0.0211+USB1*0.0996+LDHA*0.1218+LDHB*0.0123-HIBCH*0.2195+CHCHD10*0.0295；其中，所述的PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10分别表示各基因在头颈鳞癌参试样本中的mRNA表达量；Risk score表示风险评分；风险评分与患者的生存期相关，风险评分高的患者生存期短、预后差，风险评分低的患者生存期相对较长、预后相对较好。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述的用于预测头颈鳞癌预后的生存模型的构建方法具体包括如下步骤：

1）从TCGA数据库中下载头颈鳞癌患者的临床数据及头颈鳞癌组织和癌旁正常组织的RNA-Seq转录组数据；

2）通过检索“乳酸”，从MSigDB分子特征数据库中获得乳酸代谢相关基因；

3）使用Wilcox检验方法筛选出肿瘤样本和非肿瘤组织之间的乳酸代谢差异表达基因集；

4）利用单因素COX生存分析和LASSO回归分析对步骤3）中的乳酸代谢差异表达基因集进一步筛选和鉴定，筛选出如由基因PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10组成的标志物；

5）利用步骤4）得到的标志物构建用于预测头颈鳞癌预后的生存模型。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述的步骤1）中，从TCGA数据库中下载的转录组数据类型是HT Seq-FPKM值。

6.如权利要求1所述的标志物在制备用于预测头颈鳞癌预后的试剂盒中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于：所述的试剂盒包括用于检测检测基因PYGL、DARS2、YARS2、DNAJC19、ISCA1、IRAK1、SPP1、SLC25A4、FLI1、TANGO2、UQCRC2、USB1、LDHA、LDHB、HIBCH、CHCHD10的mRNA表达水平的试剂。