[发明专利]一种PLEC突变基因及其在胃神经内分泌癌中的应用

说明书

本发明首次提供了一种特定的人PLEC突变基因，该突变基因是由于野生型PLEC基因发生g.1377‑1380delATGT突变而形成的，其具体序列如SEQ ID NO：1所示，该基因突变可以做为G‑NEC化疗疗效评估的分子标志物。此外，本发明还提供了基于数字PCR的PLEC突变基因检测试剂盒和检测方法，包括如SEQ ID NO：3‑4序列所示的数字PCR引物和如SEQ ID NO：7‑8所示的数字PCR探针，可以实现灵敏特异、高效全面、快速准确的突变检测，为PLEC突变基因应用于G‑NEC化疗疗效的评估提供有效支撑，将有助于G‑NEC化疗疗效精准评估和病情监测以期指导治疗方案的制定和及时调整。

技术领域

本发明属于基因检测和应用领域，具体涉及PLEC突变基因、PLEC突变基因检测及其在胃神经内分泌癌化疗疗效评估中的应用。

背景技术

神经内分泌肿瘤（neuroendocrine neoplasm，NEN），是一组起源于肽能神经元和神经内分泌细胞的肿瘤，可发生于全身许多器官和组织，但好发于胃肠道及胰腺。胃肠胰NEN（gastroenteropancreatic NEN，GEP-NEN）是最常见的NEN 类型，比例高达65%-75%。虽然神经内分泌肿瘤的总体发病率较低，但流行病学调查显示近30年来神经内分泌肿瘤的发病率提高了约5倍。神经内分泌癌（Neuroendocrine carcinoma，NEC）早期表现不明显，然而其异质性高、分化差且恶性程度高，确诊时多为局部进展或远处转移，因此预后较差。有数据显示局部进展期患者的中位生存期为16个月，而远处转移的NEC患者中位生存期仅5个月。

化疗是GEP-NEN综合治疗的重要组成部分，也是晚期患者的主要治疗手段。以G-NEC患者为例，接受化疗的转移性G-NEC患者的生存期差异很大(从7个月到19个月)，但与仅接受最佳支持治疗(1个月)的患者相比有实质性改善。目前临床上对于G-NEC尚无标准统一的化疗方案，顺铂联合依托泊苷方案(即EP方案)是G-NEC应用最广泛的化疗方案，其缓解率最高可达30%，中位生存期约为1年。目前临床上对于G-NEC化疗疗效评估主要依靠的是常规的影像学手段和血清学指标等。然而影像学手段往往存在一定的滞后，且有时无法准确反映癌灶的分子本质；而血清标记物普遍特异性不强，其监测对于G-NEC的预后判断和诊疗指导价值有限。

包括G-NEC在内的癌症的发生和发展均涉及多个基因的时序性突变，它是一种多基因、多途径和多阶段的复杂疾病，源于此目前绝大多数癌症的发生发展机制尚未得到充分解析。不同的分子特征不仅决定癌症的生长、进展、侵袭与转移，也决定了其对特定治疗手段（包括化疗）的响应情况，也即患者的预后情况。由于分子特征改变早于细胞组织和影像学形态，因此其具有良好的时效性和预测价值。所以寻找敏感、特异的肿瘤分子标志物对于早期评估化疗疗效、监测疾病进展和及时更换耐药方案具有积极的临床意义。目前尚缺乏精准有效的G-NEC化疗疗效分子标志物，而既往G-NEC病例和样本是良好的切入点。既往G-NEC病例数量众多样本丰富，且其治疗信息和临床结局已知；此外随着二代DNA测序技术的应用，对于长期保存的临床样本特别是病理石蜡块也可以很好进行解析。因此从既往病例出发进行合理分组分析，有助于快速筛选癌症发生发展相关的重要基因突变，进而寻找特异有效的临床分子标志物。

发明内容

针对目前临床上缺乏特异有效的胃神经内分泌癌化疗疗效评估分子标志物的不足，本发明提供了与此相关的PLEC基因特定突变及其检测方法，并将其应用于胃神经内分泌癌的化疗疗效评估中。这些可以为胃神经内分泌癌化疗疗效评估、疾病进展监测、治疗方案调整和发生发展机制解析等提供依据和基础。

本发明解决其技术问题所采用的技术方案如下：