[发明专利]一种与鸡肤色和屠体性状相关的CDK5基因分子标记及应用有效
| 申请号： | 202210949400.1 | 申请日： | 2022-08-09 |
| 公开（公告）号： | CN115820870B | 公开（公告）日： | 2023-10-13 |
| 发明（设计）人： | 聂庆华;林铎;徐振强;周震;张德祥;蔡柏林;何彤;徐海平;詹惠娜 | 申请（专利权）人： | 华南农业大学;温氏食品集团股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 | 代理人： | 李哲 |
| 地址： | 510640 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 肤色 体性 相关 cdk5 基因 分子 标记 应用 | ||
1.一种与鸡肤色和屠体性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于鸡CDK5基因上，所述CDK5基因的登录号为GeneID:100190948，所述分子标记包括SNP1-SNP4，其中，SNP1为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318206CT；SNP2为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318251CT；SNP3为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318256CT；SNP4为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052533.1：g318338CT。
2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，SNP1存在基因型CC、CT和TT；SNP2存在基因型CC、CT和TT；SNP3存在基因型CC、CT和TT；SNP4存在基因型CC、CT和TT。
3.一种根据权利要求1-2任一项所述的分子标记鉴别鸡肤色和屠体性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)以待测鸡基因组DNA为模板，利用引物扩增包括权利要求1-2所述分子标记的基因片段，获取扩增产物；
(2)对所述扩增产物测序，检测相应单核苷酸多态性位点的基因型，根据检测的基因型判断待测鸡的肤色和屠体性状；
其中，在SNP1中，CC基因型个体表现为最高的肌胸率；在SNP2中，CC基因型和CT基因型个体表现为较高的颈部肤色黄度值；在SNP3中，CC基因型和CT基因型个体表现为较高的胫部肤色黄度值和臀部皮肤黄度值；在SNP4中，CC基因型和CT基因型个体表现为较高的肌胸率。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中，所述引物包括如SEQ ID NO:2所示序列的上游引物和如SEQ ID NO:3所示序列的下游引物。
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中，所述扩增的扩增反应体系为：模板DNA 2μL、2×Es Taq MasterMix 25μL、上游引物2μL、下游引物2μL、ddH2O 19μL。
6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中，所述扩增的扩增反应程序为：94℃预变性2min；94℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸30s，32个循环；72℃最终延伸3min；4℃保存。
7.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述肤色和屠体性状包括：胸肌率、胫部皮肤黄度值、臀部皮肤黄度值和腿部皮肤黄度值。
8.根据权利要求1-2任一项所述的分子标记在鸡育种中的应用。
9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，应用于鸡肤色和屠体性状的选育中。
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