[发明专利]一种染色体图像拼接方法及染色体核型分析方法有效
| 申请号: | 202210933205.X | 申请日: | 2022-08-04 |
| 公开(公告)号: | CN115063412B | 公开(公告)日: | 2022-11-29 |
| 发明(设计)人: | 邓福韬;卢沁阳;徐思;穆阳;彭伟雄 | 申请(专利权)人: | 湖南自兴智慧医疗科技有限公司 |
| 主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T3/40;G06T7/10 |
| 代理公司: | 长沙市岳麓慧专利代理事务所(普通合伙) 43270 | 代理人: | 王中华 |
| 地址: | 410006 湖南省长沙市长沙*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 染色体 图像 拼接 方法 核型 分析 | ||
1.一种染色体图像拼接方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、读入染色体图像,读入拍摄的两条不同染色体的图像,各染色体均具有异常位点;
S2、染色体片段分割,利用分别经过两条染色体异常位点的两切割线对该两条染色体进行切割,形成四个染色体片段;
S3、染色体片段对齐,旋转每个染色体片段使切割线与水平线平行,然后选择需要进行拼接的两个染色体片段,将该两个染色体片段的切割线进行对齐,使两切割面宽度相等;
S4、染色体片段连接,将对齐后的两染色体片段连接起来,得到一条新染色体图像L,原切割线形成连接线;
S5、自编码网络重构,以连接线为中轴线,确定上下N个像素范围的矩形区域,再将新染色体图像输入自编码网络中,得到重构后的染色体图像P;
S6、非连接区域还原,将重构后的染色体图像P,除矩形区域外的所有像素点的像素值还原为染色体图像L上的像素值,得到拼接后的染色体图像。
2.如权利要求1所述的染色体图像拼接方法,其特征在于,步骤S3中,旋转每个染色体片段使切割线与水平线平行包括:计算染色体片段切割线上的点的斜率k,再根据斜率k计算切割线与水平线的角度d,最后以染色体片段切割线上所有点的中心为旋转中心,旋转角度为角度d,进行旋转操作。
3.如权利要求1所述的染色体图像拼接方法,其特征在于,步骤S3中,将该两个染色体片段的切割线进行对齐包括:分别计算两染色体片段的切割线的染色体宽度,计算方法为求切面上像素值不为255的第一个像素点和最后一个像素点之间的距离;取其中一宽度做为基准值,对另一染色体片段进行宽度上的尺寸缩放,使得缩放后两染色体片段的切割面的宽度相等。
4.如权利要求1所述的染色体图像拼接方法,其特征在于,步骤S5中,N=5。
5.如权利要求1所述的染色体图像拼接方法,其特征在于,步骤S6中,非连接区域还原包括如下步骤:
S61、将重构染色体图片P中非矩形区域中的像素点的像素值置为0;
S62、将染色体图片L中矩形区域中的像素点的像素值置为0;
S63、将S61和S62处理后的染色体图片P和染色体图片L逐像素进行相加,得到最终结果图像,即拼接后的染色体图像。
6.一种染色体核型分析方法,其特征在于,包括:获取中期染色体分裂相图像;对多条染色体图像采用如权利要求1至5中任一所述的染色体图像拼接方法形成拼接后的染色体图像作为异常染色体参考图像;将异常染色体参考图像与真实异常染色体图像进行比较,得到染色体的异常类型。
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