[发明专利]一种鉴定豫西黑猪品种的特异分子身份证及其应用

说明书

本发明属于猪品种鉴定领域，涉及豫西黑猪种质资源，特别是指一种鉴定豫西黑猪品种的特异分子身份证及其应用。通过SNP分子标记对确山黑猪品种进行研究，采用生物信息学技术综合分析，并将研究结果进行初步验证，构建豫西黑猪的品种特异性分子标记，可简单明了地区分豫西黑猪与其他地方猪品种间的差异，可用于豫西黑猪品种的真伪鉴定和遗传关系分析，为豫西黑猪品种的知识产权保护提供了有效的科学依据。在豫西黑猪品种鉴定评价时，只需将豫西黑猪品种与已有特异性分子身份证比较分析，即可确定其是否为豫西黑猪品种。这大大降低了豫西黑猪种质资源鉴定评价的时间和费用，提高了豫西黑猪品种鉴定评价的效率。

技术领域

本发明属于猪品种鉴定领域，涉及豫西黑猪种质资源，特别是指一种鉴定豫西黑猪品种的特异分子身份证及其应用。

背景技术

豫西黑猪分布在河南省三门峡市，是以优良地方猪：南阳黑猪、二花脸猪、莱芜猪和西方商品猪：杜洛克猪作为基础群，世代培育而成，具有繁殖力强、肉质好、抗病性高、耐粗饲等优良特征。在优势品种的选育过程中，需要探索新的技术和手段为优良品种的培育提供保障。如何快速高效的对畜禽品种进行分子识别和品种鉴定，成为品种能够在生产中进行开发利用和可持续发展的关键。对地方品种的有效保护和合理开发，将有助于河南省养猪业的可持续发展和家畜资源多样性的丰富。特别是对地方猪品种的特异性遗传结构和表征的研究，将有助于根据品种遗传情况制定对每个品种的保护计划，促进对地方猪品种的具体保护。保存每个品种的独特变异、基因和特征对于维持生物多样性和适应未来环境变化极为重要。因此，利用生物信息技术鉴定河南地方猪品种独特的遗传特征是准确保护地方猪种质遗传资源的重要部分。

随着测序技术的发展，芯片测序技术成为高通量SNP分型的有力工具。与此同时，在动物受到长期的自然选择和人工选择时，会在其基因组上留下相应的遗传印记。这些遗传印记通常被称为选择信号。选择信号的研究是基于基因组到表型概念的一种研究策略。由于我国地方猪种表型记录的缺乏和种群规模小，对家畜种质特征的分析日益成为一种重要的方法。为了实现批量检测豫西黑猪，本课题组进行了长期的探索。

发明内容

为实现上述目的，本发明提出一种鉴定豫西黑猪品种的特异分子身份证及其应用。

本发明的技术方案是这样实现的：

一种鉴定豫西黑猪品种的特异分子身份证，所述SNP位点为豫西黑猪品种间等位基因频率较高的SNP位点集合。

优选的，所述SNP位点位于猪参考基因组EnsemblSscrofa 11.1版本。

所述SNP位点的集合包括CNC10013894位点G/A、CNC10014056位点C/T、CNC10020115位点T/C、CNC10020130位点A/C、CNC10020514位点C/T、CNC10023146位点、CNC10023149位点、CNC10031517位点、CNC10031852位点、CNC10032441位点、CNC10042061位点、CNC10042622位点、CNC10050243位点、CNC10050264位点、CNC10050750位点、CNC10050761位点、CNC10061222位点、CNC10061407位点、CNC10062206位点、CNC10062339位点、CNC10062741位点、CNC10070087位点、CNC10071263位点、CNC10081973位点、CNC10082066位点、CNC10090634位点、CNC10090641位点、CNC10090931位点、CNC10091691位点、CNC10111302位点、CNC10130645位点、CNC10133474位点、CNC10134130位点、CNC10140524位点、CNC10140877位点、CNC10151220位点、CNC10151229位点、CNC10151231位点、CNC10152118位点和CNC10171124位点。