[发明专利]一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用，属于分子育种技术领域。该SNP分子标记对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus6.0版本序列信息11号染色体第18,362,638位，此处碱基为G/A，GG基因型个体的腹脂重显著小于AA基因型个体。使用该分子标记进行标记辅助选择，能够降低鸡腹脂的沉积，节省生产成本并加快遗传进展。利用本发明分子标记构建的检测方法，成本低、操作简便，具有重要的实际应用价值。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

随着肉鸡行业的快速发展和集约化选择，导致肉鸡体内脂肪(尤其是腹部脂肪)过度沉积。而肉鸡腹部脂肪沉积过多会对胴体产量、饲料转化率、生育率和孵化率等产生不利影响。这些问题是造成全球肉鸡生产者遭受重大经济损失的原因。因此控制鸡腹部脂肪沉积，是肉鸡育种者们的主要目标之一。然而，由于鸡腹部脂肪测量的复杂性，大大阻碍基于腹部脂肪测量的遗传改良，因此在这种情况下，分子标记辅助选择(MAS)是提高选择效率的有效方法，用于促进生产低腹脂的鸡。

肉鸡的腹脂是一个高遗传力的性状，腹脂遗传力在0.50-0.80，表明遗传选择能有效减少肉鸡腹脂过度沉积。目前对肉鸡的腹脂含量采用直接选择育种已经取得了一定的进展，而通过分子标记手段从遗传上可进一步降低肉鸡的腹脂沉积。与腹脂重相关的遗传变异可以用遗传标记进行关联，通过对标记的选择而同时改善肉鸡的腹脂沉积。全基因组关联分析是鉴定表型和基因型之间遗传联系的最主要手段之一。为鉴定表型和基因型之间的遗传联系，便于对腹脂重进行早期选择，节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于鸡的育种。因此，与肉鸡腹脂重性状相关的分子标记的研究具有重要意义。

发明内容

本发明为了准确地确定待测鸡的基因型以方便对腹脂重性状进行早期选择，节省生产成本并加快遗传进展，提供了一种与鸡腹脂性状相关的分子标记及其应用，为分子标记育种选育工作提供基础。

一种与鸡腹脂重性状相关的SNP分子标记，所述SNP(单核苷酸多态性)分子标记位于11号染色体第18,362,638,rs14028856。

本发明中，分子标记chr11:18362638所含多态性位点的基因型为GG，对应于低腹脂重水平，所含多态性位点的基因型为GA，对应于腹脂重水平居中，所含多态性位点的基因型为AA，对应于高腹脂重水平。

本发明还提供一种上述的与鸡腹脂重相关的分子标记的检测试剂在检测鸡腹脂重中的应用。

本发明还提供一种用于扩增chr11:18362638分子标记的引物。其序列如SEQ IDNO:1-2所示。

上游引物F：ATGCTCACCTGGAATAACCCC(SEQ ID NO.1)

下游引物R：GCGCAGATAAGATGGCAGGTA(SEQ ID NO.2)

本发明还提供一种上述的引物在检测鸡的腹脂重或制备检测鸡的腹脂重的试剂盒中的应用。

本发明还提供一种用于检测鸡腹脂重的试剂盒，包括上述的引物。

本发明还提供一种检测鸡腹脂重的方法，检测待测样本鸡中如上述的分子标记的基因型。

一种与鸡的腹脂重性状相关的分子标记及其应用，为根据上述SNP位点的基因型对鸡腹脂重性状进行早期选择，包括如下步骤：

(1)提取待测鸡的基因组DNA；

(2)利用上述的引物进行PCR扩增，检测待测鸡11号染色体第18,362,638位SNP位点的基因型；

(3)将所述扩增产物经测序后，获取分子标记的基因型；

(4)根据基因分型结果，判断所述待测样本鸡的腹脂性状。