[发明专利]细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法有效
| 申请号: | 202210736014.4 | 申请日: | 2022-06-27 |
| 公开(公告)号: | CN115100646B | 公开(公告)日: | 2023-01-31 |
| 发明(设计)人: | 曹得华;李诚;严姗;刘赛;龙莉;李荣;庞宝川 | 申请(专利权)人: | 武汉兰丁智能医学股份有限公司 |
| 主分类号: | G06V20/69 | 分类号: | G06V20/69;G06V10/22;G06T3/40 |
| 代理公司: | 武汉维盾知识产权代理事务所(普通合伙) 42244 | 代理人: | 刘翠霞 |
| 地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 细胞 图像 清晰 快速 拼接 识别 标记 方法 | ||
1.一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是包括以下步骤:
S1、阵列扫描玻片获得多个原始图像;
S2、确定图像可供识别的最小分辨率,按最小分辨率裁剪原始图像;
S3、将最小分辨率图像拼接成全视野图,储存拼接坐标数据;
S4、以目标检测模型获取可疑细胞位置,储存可疑细胞位置数据;
目标检测模型包括YoloV4、YoloV3、YoloV5、SSD、RetineDet、RefinaDet或EfficientDet模型中的一种,目标检测模型用于将正常细胞之外的细胞标注出来,形成可疑细胞数据集;
S5、垃圾分类模型剔除垃圾细胞,储存垃圾细胞位置数据;
垃圾分类模型包括YoloV4、YoloV3、YoloV5、SSD、RetineDet、RefinaDet或EfficientDet模型中的一种,用于将垃圾剔除,并形成非垃圾细胞数据集;
垃圾分类模型以可疑细胞数据集为剔除范围;
S6、阴阳分类模型识别阳性细胞,储存阳性细胞位置数据;
阴阳分类模型包括EfficientNet、ResNet50系列、Inception、Xception和ImageNet系列,用于将阴性细胞和阳性细胞分类,形成阳性细胞数据集;
阴阳分类模型以非垃圾细胞数据集为分类范围;
S01、与S1同步的,确定图像的最佳分辨率,按最佳分辨率裁剪各个原始图像,根据拼接坐标数据和缩放比将各个最佳分辨率图像进行拼接,获得最佳分辨率拼接图像;
S02、根据可疑细胞位置数据、垃圾细胞位置数据、阳性细胞位置数据将标记添加到最佳分辨率拼接图像;
通过以上步骤实现细胞图像高清晰快速拼接识别标记。
2.根据权利要求1所述的一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是:在步骤S1中,阵列扫描玻片过程中,控制每次扫描的步进值相同,根据扫描路径获得各个图片的行列值,并储存。
3.根据权利要求2所述的一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是:在步骤S3中,拼接的具体步骤为:
S31、读取1行1列和1行2列图像,扫描像素获得图像重叠视野,将图像重叠视野水平堆叠拼接;
同步的,读取1行1列和2行1列图像,扫描像素获得图像重叠视野,将图像重叠视野垂直堆叠拼接;
S32、获取图像x、y向相对重叠坐标;
S33、后继其他图像依据行列值和x、y向相对重叠坐标进行拼接。
4.根据权利要求3所述的一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是:步骤S2中,最小分辨率裁剪原始图像时,获得最小缩放比例;
步骤S01中,以最佳分辨率裁剪原始图像时,获得最佳缩放比例;
根据步骤32中适于最小分辨率图像的相对重叠坐标、最小缩放比例和最佳缩放比例,将相对重叠坐标转换成适于最佳分辨率图像的相对重叠坐标;
将各个最佳分辨率图像按照适于最佳分辨率图像的相对重叠坐标进行拼接。
5.根据权利要求4所述的一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是:将可疑细胞位置数据、垃圾细胞位置数据和阳性细胞位置数据根据缩放比、各个图片的行列值和适于最佳分辨率图像的相对重叠坐标转换成适于最佳分辨率图像的位置数据,并根据所述的位置数据在拼接后的全视野最佳分辨率图像上进行标注。
6.根据权利要求1所述的一种细胞图像高清晰快速拼接识别标记方法,其特征是:还包括多分类模型,多分类模型包括EfficientNet、ResNet50系列、Inception、Xception和ImageNet系列,用于将阳性细胞分级并统计,多分类模型以阳性细胞数据集为工作范围。
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