[发明专利]一种用于检测HPV的液相杂交捕获探针、应用及其试剂盒有效
| 申请号: | 202210713963.0 | 申请日: | 2022-06-22 |
| 公开(公告)号: | CN115011594B | 公开(公告)日: | 2023-10-20 |
| 发明(设计)人: | 余丽萍;汪彪;吴强;冀长泉;李晨 | 申请(专利权)人: | 纳昂达(南京)生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6806;C12Q1/6886;G16B25/20 |
| 代理公司: | 南京华讯知识产权代理事务所(普通合伙) 32413 | 代理人: | 刘怡彣 |
| 地址: | 210000 江苏省南京市江北新区华康路*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 检测 hpv 杂交 捕获 探针 应用 及其 试剂盒 | ||
1.一组用于检测HPV的探针,其特征在于,所述探针包括:(1)与另一探针互补配对的探针结合序列,以及(2)与HPV病原体序列互补配对的靶特异性序列。
2.根据权利要求1所述的探针,其特征在于,所述探针结合序列包括第一探针结合序列和第二探针结合序列。
3.根据权利要求2所述的探针,其特征在于,所述探针的5’端具有与另一探针的3’端互补配对的第一探针结合序列,并且所述探针的3’端具有与另一探针的5’端部互补配对的第二探针结合序列。
4.根据权利要求1所述的探针,其特征在于,所述靶特异性序列的长度为20-80nt。
5.根据权利要求1所述的探针,其特征在于,所述探针结合序列的长度为8-30nt。
6.根据权利要求3所述的探针,其特征在于,所述探针5’端与另一探针互补配对的第一探针结合序列长度为8-30nt,所述探针3’端与另一探针互补配对的第二探针结合序列长度为8-30nt。
7.根据权利要求1所述的探针,其特征在于,所述探针的3’端或5’端带有生物标记物。
8.根据权利要求7所述的探针,其特征在于,所述生物标记物为生物素。
9.根据权利要求1-8的探针在制备用于HPV检测试剂中的应用,其特征在于,所述探针可以透过杂交捕获的方式进行检测。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述杂交捕获包括如下步骤:
(1)杂交捕获
i.配置杂交体系:所述杂交体系包含所述探针;
ii.杂交反应:将所述杂交体系置于55~65℃进行杂交1~2小时;
(2)产物捕获:杂交反应结束后,反应体系中加入链霉亲和素磁珠进行杂交捕获;
(3)产物洗脱:捕获结束后,使用洗脱缓冲液I、洗脱缓冲液II
以及洗脱缓冲液III各洗涤1次;
(4)产物扩增纯化:洗涤结束后,加入PCR反应体系,进行PCR扩增程序,反应结束后,使用磁珠进行纯化。
11.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述杂交体系中包含2-10fmol的探针、1×Hyb Buffer、1×Enhance、1μg Human Cot-1,以及100pmmol的Blocker。
12.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述杂交反应的条件为95℃变性2分钟、60℃杂交1小时。
13.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述产物捕获的条件为60℃捕获20分钟。
14.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,所述洗脱缓冲液I的配方为5×SSPE、0.5%~5%SDS;所述洗脱缓冲液II的配方为2×SSPE、0.05%~0.5%SDS;所述洗脱缓冲液III的配方为0.1×SSPE、0.005%~0.05%SDS。
15.一种用于检测HPV的杂交捕获试剂盒,其特征在于,包括如下组分:探针、杂交反应液、洗脱缓冲液、链霉亲和素磁珠、核酸纯化磁珠;所述探针包括与另一探针互补配对的探针结合序列以及与HPV病原体序列互补配对的靶特异性序列。
16.根据权利要求14所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括末端修复酶混合物、末端修复反应缓冲液、含分子标签的接头、文库扩增引物、PCR预混液、接头封闭剂、DNA封闭剂、杂交增强剂、磁珠洗涤液、捕获文库PCR引物。
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