[发明专利]一种非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预测模型的训练方法以及预测装置有效

专利信息
申请号: 202210693286.0 申请日: 2022-06-17
公开(公告)号: CN114999653B 公开(公告)日: 2023-06-20
发明(设计)人: 应建明;李文斌;宋朋;吴小璇 申请(专利权)人: 中国医学科学院肿瘤医院
主分类号: G16H50/30 分类号: G16H50/30;C12Q1/6886;G16B20/50
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 覃蛟
地址: 100021 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 细胞 肺癌 免疫 治疗 疗效 预测 模型 训练 方法 以及 装置
【权利要求书】:

1.一种非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预测模型的训练方法,其特征在于,其包括:

获取训练样本KEAP1、PTPRD、EPHA3、EPHA5、ZFHX3、MGA、NTRK3和PBRM1基因突变的检测结果以及对应的标注结果;

将基因突变的检测结果输入预先构建好的预测模型中,获得预测结果;其中,所述预测模型用于根据KEAP1、PTPRD、EPHA3、EPHA5、ZFHX3、MGA、NTRK3和PBRM1基因突变的数量预测样本非小细胞肺癌的免疫治疗疗效;

基于所述标注结果和所述预测结果对所述预测模型进行参数更新;

所述预测模型通过以下公式进行计算并获得预测结果;

Risk Score=(a×KEAP1)+(b×PTPRD)+(c×EPHA3)+(d×EPHA5)+(e×ZFHX3)+(f×MGA)+(g×NTRK3)+(h×PBRM1);

其中,a为0.2~0.6,b为-0.1~-0.6,c为-0.2~-0.6,d为-0.6~-1.0,e为-1~-1.4,f为-0.4~-0.8,g为-0.5~-0.9,h为0.8~1.2;

KEAP1为KEAP1基因的突变参数,若KEAP1基因的编码区存在基因突变,则KEAP1记为1,否则记为0;PTPRD为PTPRD基因的突变参数,若PTPRD基因的编码区存在基因突变,则PTPRD记为1,否则记为0;EPHA3为EPHA3基因的突变参数,若EPHA3基因的编码区存在基因突变,则EPHA3记为1,否则记为0;EPHA5为EPHA5基因的突变参数,若EPHA5基因的编码区存在基因突变,则EPHA5记为1,否则记为0;ZFHX3为ZFHX3基因的突变参数,若ZFHX3基因的编码区存在基因突变,则ZFHX3记为1,否则记为0;MGA为MGA基因的突变参数,若MGA基因的编码区存在基因突变,则MGA记为1,否则记为0;NTRK3为NTRK3基因的突变参数,若NTRK3基因的编码区存在基因突变,则NTRK3记为1,否则记为0;PBRM1为PBRM1基因的突变参数,若PBRM1基因的编码区存在基因突变,则PBRM1记为1,否则记为0。

2.根据权利要求1所述的训练方法,其特征在于,所述基因突变包括编码区的突变。

3.根据权利要求1所述的训练方法,其特征在于,所述基因突变为导致编码蛋白的氨基酸序列改变的突变。

4.一种非小细胞肺癌免疫治疗疗效的预测装置,其特征在于,其包括:

获取模块,用于获取待测样本KEAP1、PTPRD、EPHA3、EPHA5、ZFHX3、MGA、NTRK3和PBRM1基因突变的检测结果;

预测模块,用于将基因突变的检测结果输入如权利要求1~3任一项所述的训练方法训练好的预测模型中,获得待测样本的预测结果;

所述预测模型通过以下公式进行计算并获得预测结果;

Risk Score=(a×KEAP1)+(b×PTPRD)+(c×EPHA3)+(d×EPHA5)+(e×ZFHX3)+(f×MGA)+(g×NTRK3)+(h×PBRM1);

其中,a为0.2~0.6,b为-0.1~-0.6,c为-0.2~-0.6,d为-0.6~-1.0,e为-1~-1.4,f为-0.4~-0.8,g为-0.5~-0.9,h为0.8~1.2;

KEAP1为KEAP1基因的突变参数,若KEAP1基因的编码区存在基因突变,则KEAP1记为1,否则记为0;PTPRD为PTPRD基因的突变参数,若PTPRD基因的编码区存在基因突变,则PTPRD记为1,否则记为0;EPHA3为EPHA3基因的突变参数,若EPHA3基因的编码区存在基因突变,则EPHA3记为1,否则记为0;EPHA5为EPHA5基因的突变参数,若EPHA5基因的编码区存在基因突变,则EPHA5记为1,否则记为0;ZFHX3为ZFHX3基因的突变参数,若ZFHX3基因的编码区存在基因突变,则ZFHX3记为1,否则记为0;MGA为MGA基因的突变参数,若MGA基因的编码区存在基因突变,则MGA记为1,否则记为0;NTRK3为NTRK3基因的突变参数,若NTRK3基因的编码区存在基因突变,则NTRK3记为1,否则记为0;PBRM1为PBRM1基因的突变参数,若PBRM1基因的编码区存在基因突变,则PBRM1记为1,否则记为0。

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