[发明专利]化学探针鉴定与评估方法、装置

说明书

本发明提出一种化学探针鉴定与评估方法、装置，所述方法包括：对经过轻重同位素标记的给定化学探针质谱实验数据集搜索，确定高丰度蛋白质的常见质量修饰数据集；对所述常见质量修饰数据集通过盲搜，确定含有未知质量修饰的谱图作为候选未知质量修饰数据集；对所述候选未知质量修饰数据集通过可信度评估，筛选出高可信度未知质量修饰数据集；将所述常见质量修饰数据集与高可信度未知质量修饰数据集结合后，通过限定式搜索得到目标未知质量修饰。通过该方法在保证可信度的条件下，对目标未知质量修饰能够进行精准刻画和有效评估。

技术领域

本发明涉及串联质谱技术领域，尤其涉及一种化学探针鉴定与评估方法、装置、介质。

背景技术

目前，基于串联质谱技术的化学蛋白质组学鉴定是研究的热点，其中，利用蛋白质串联质谱推断肽段的氨基酸序列已经成为高通量、大规模蛋白质鉴定的尤为重要的一步。基于串联质谱技术的化学蛋白质组学鉴定的目的是识别串联质谱图中包含的肽段完整或部分序列。具体来说：先根据预设的酶切规则对序列库中的蛋白质序列进行模拟酶切，生成理论肽段；对于待鉴定的串联质谱图筛选，通过母离子质量范围限制得到候选肽；通过模拟候选肽生成的谱图和实际谱图的相似性，确定最终鉴定结果。由于肽段可以在其基本氨基酸序列之外存在无数种形式，如翻译后修饰和化学样品处理过程中的意外修饰，如果考虑所有的修饰会导致搜索空间太大，因此传统的数据库搜索会限定小集合的修饰，导致存在大量未解释的谱图，无法鉴定未指定的修饰等。

由于传统的数据库搜索对于未知质量修饰的处理能力有限，通常情况下，仅通过将无法解释的质量进行统计，得到修饰质量粗略的估计，缺少对其深入的建模和数据集级别的信息；同时，导致缺少对修饰位点分布、可能发生的中性丢失等其他有效信息的分析。且传统的数据库搜索方法都是以提升质谱数据鉴定解析为中心，而非对未知质量修饰刻画和评估为中心，无法进一步评估目标未知质量修饰的性能。因此，如何在保证可信度的条件下，对目标未知质量修饰进行精准刻画和有效评估成为基于串联质谱技术的化学蛋白质组学鉴定中亟需解决的问题。

发明内容

针对现有技术的不足，本发明提出一种化学探针鉴定与评估方法、装置，该方法在保证可信度的条件下，对目标未知质量修饰能够进行精准刻画和有效评估。

为了实现上述目的，本发明一方面提供一种化学探针鉴定与评估方法，包括：

对经过轻重同位素标记的给定化学探针质谱实验数据集搜索，确定高丰度蛋白质的常见质量修饰数据集；

对所述常见质量修饰数据集通过盲搜，确定含有未知质量修饰的谱图作为候选未知质量修饰数据集；

对所述候选未知质量修饰数据集通过可信度评估，筛选出高可信度未知质量修饰数据集；

将所述常见质量修饰数据集与高可信度未知质量修饰数据集结合后，通过限定式搜索得到目标未知质量修饰。

可选的，所述对所述候选未知质量修饰数据集通过可信度评估，筛选出高可信度未知质量修饰数据集，包括：

对所述候选未知质量修饰数据集通过误差纠正进行质量校正；

对质量校正后的所述候选未知质量修饰数据集进行第一可信度评估；

对质量校正后的所述候选未知质量修饰数据集中统计修饰发生的氨基酸位点，并对低质量位点进行过滤；

对位点过滤后的所述候选未知质量修饰数据集进行第二可信度度评估；

识别位点过滤后的所述候选未知质量修饰数据集中存在的中性丢失质量；

依据识别的中性丢失质量对位点过滤后的所述候选未知质量修饰数据集进一步筛选，得到高可信度未知质量修饰数据集。

可选的，所述对所述候选未知质量修饰数据集通过误差纠正进行质量校正，包括：