[发明专利]蛋白质数据处理方法、装置、电子设备以及存储介质在审
申请号: | 202210655833.6 | 申请日: | 2022-06-10 |
公开(公告)号: | CN114999564A | 公开(公告)日: | 2022-09-02 |
发明(设计)人: | 成晓亮;郑和龙;周岳;张伟;郑可嘉 | 申请(专利权)人: | 江苏品生医疗科技集团有限公司;南京品生医疗科技有限公司 |
主分类号: | G16B15/20 | 分类号: | G16B15/20;G16B50/30;G06K9/62 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 马迪 |
地址: | 210000 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋白质 数据处理 方法 装置 电子设备 以及 存储 介质 | ||
1.一种蛋白质数据处理方法,其特征在于,包括:
获取各样本在任意时序内各时刻的至少一个原始肽段数据,对各所述原始肽段数据进行数据处理,得到各所述样本在当前时序内各时刻的蛋白数据组;
对于蛋白数据组中的任一蛋白数据,基于预设的差异筛选条件对任意两组样本的蛋白数据进行差异分析,得到当前两组样本对于当前蛋白数据的差异蛋白;
基于预设的初始聚类中心点对当前时序内各时刻的各所述差异蛋白进行聚类处理,得到所述当前时序的差异蛋白的目标聚类结果;其中,所述目标聚类结果包括至少一个目标聚类中心点;
分别对各所述目标聚类中心点的蛋白数据进行富集分析,得到所述目标聚类结果的富集分析结果;其中,所述富集分析结果包括各所述目标聚类中心点的蛋白数据分别对应的各中心点蛋白富集分析结果和各所述中心点蛋白富集分析结果的中心点蛋白富集分析比较结果。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述蛋白数据组包括至少一个蛋白数据和各所述蛋白数据分别对应的蛋白标识;
相应的,所述对各所述原始肽段数据进行数据处理,得到各所述样本在当前时序内各时刻的蛋白数据组,包括:
对于当前时刻的各所述原始肽段数据,基于预设肽段筛选条件对各所述原始肽段数据进行数据筛选,得到各目标肽段数据;
分别确定各所述目标肽段数据所属的蛋白标识,基于所述蛋白标识、各所述目标肽段数据以及各所述目标肽段数据所属样本的样本标识,生成各所述样本的至少一个蛋白数据。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述得到各所述样本在当前时序内各时刻的蛋白数据组之后,还包括:
分别确定各样本中目标肽段数据的肽段鉴定数量和蛋白数据组中的蛋白鉴定数量;
分别对各样本的蛋白数据进行主成分分析,确定当前样本的蛋白数据中至少一个主要蛋白成分的成分信息,对各所述成分信息进行降维处理,得到降维后的成分信息;
确定各所述样本的样本分类结果,分别对各类样本的蛋白数据进行相对标准偏差分析,得到各类样本的分析结果。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于预设的差异筛选条件对任意两组样本的蛋白数据进行差异分析,得到当前两组样本对于当前蛋白数据的差异蛋白,包括:
获取预设的差异分析模型,将所述差异筛选条件和任意两组样本的蛋白数据作为输入信息,输入至所述差异分析模型中,得到所述差异分析模型输出的当前两组样本的差异蛋白。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述分别对各所述目标聚类中心点的蛋白数据进行富集分析,得到所述目标聚类结果的富集分析结果,包括:
基于预设的富集分析数据库、将任一目标聚类中心点的各差异蛋白输入至所述富集分析数据库中,得到所述富集分析数据库输出的当前目标聚类中心点对应的中心点蛋白富集分析结果;
对所述各所述目标聚类中心点的蛋白数据分别对应的各中心点蛋白富集分析结果进行比较处理,得到各所述中心点蛋白富集分析结果的中心点蛋白富集分析比较结果。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述富集分析数据库包括KEGG数据库;
相应的,在得到所述目标聚类结果的富集分析结果之后,还包括:
获取所述KEGG数据库中预设的结果输出通道,将所述中心点蛋白富集分析结果和目标富集分析比较结果经过所述结果输出通道进行输出并展示。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述得到当前两组蛋白数据对于当前蛋白数据标签的差异蛋白之后,还包括:
基于预设的相关性分析方法,对各所述差异蛋白进行相关性分析,得到所述各所述差异蛋白之间的相关性分析结果;
基于预设的相互作用分析方法,对各所述差异蛋白进行相互作用分析,得到各所述差异蛋白之间的相互作用分析结果;
基于预设的富集分析数据库,对各所述差异蛋白进行富集分析,得到所述各所述差异蛋白的蛋白富集分析结果,并对各所述蛋白富集分析结果进行比较处理,得到各所述蛋白富集分析结果的蛋白富集分析比较结果。
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