[发明专利]索拉非尼耐药分子标记物及其相关试剂的应用

说明书

本发明公开了一种索拉非尼耐药分子标记物及其相关试剂应用。所述索拉非尼耐药标记物为CTNNB1或者是与CTNNB1相关联的一组标记物中的任意一种，所述与CTNNB1相关联的一组标记物为PIK3CA、HNRNPUL2‑BSCL2、PAXIP1、CDKL5、LZTFL1、S1PR2、KLHL11、RP11‑159G9.5、FAM171A2、ZBED6、PELI1、PRIM1。上述索拉非尼耐药标记物可用于预测索拉非尼的药效。通过对肝癌患者的组织转录组测序，或通过PCR、基因芯片、组织芯片、NanoString技术、免疫组化的方法检测相关分子的表达，可为索拉非尼的用药与肝癌的精准治疗提供线索。

技术领域

本发明属于生物医学技术领域，尤其涉及肿瘤领域，具体为一种索拉非尼耐药分子标记物及其相关试剂应用。

背景技术

原发性肝癌(Primary liver cancer，PLC)在我国目前常见的恶性肿瘤中，发病率排第四位，死亡率排第二位，严重威胁我国人民的生命和健康。肝癌早期患者(巴塞罗纳0期A期)，手术切除和肝移植等治疗可以有效地提高肝癌患者的治愈率和生存预后。然而由于肝癌起病隐匿，早期症状缺乏特异性，很多患者被诊断为肝癌时，就已经处于中期或晚期。长期以来，由于药物治疗方案少，而且临床有效率低，中晚期肝癌普遍显示预后差、生存率低。

索拉非尼(Sorafenib)是最早用于肝癌治疗药物，可作用于CRAF、BRAF、V600EBRAF、c-Kit、FLT-3、VEGFR-2、VEGFR-3、PDGFR-β靶点，起到抑制肿瘤细胞增殖和抗血管生成作用。然而，索拉非尼仅能将中位生存期提高三个月，且有效率低，尚不足10％、而且出现了很多无效治疗现象。因此，亟需索拉非尼的药敏分子分型方案，提高肝癌治疗疗效。

发明内容

为了克服现有技术的问题，本发明的第一个目的在于提供一种索拉非尼耐药标记物，采用其可对索拉非尼耐药人群进行提示，为肝癌精准治疗提供依据。本发明的第二个目的提出索拉非尼耐药标记物在非治疗目的的索拉非尼用药研究中的应用。本发明的第三个目的是，提供该索拉非尼耐药标记物相关试剂的一些应用，该标记物的相关试剂包括：检测其表达的定量试剂、抑制剂等，这些相关试剂的应用能够填补肝癌精准诊疗领域的空白。

本发明的目的是这样实现的：

本发明的第一方面：发现CTNNB1及以CTNNB1为核心的一组基因PIK3CA、HNRNPUL2-BSCL2、PAXIP1、CDKL5、LZTFL1、S1PR2、KLHL11、RP11-159G9.5、FAM171A2、ZBED6、PELI1、PRIM1的高表达与索拉非尼耐药相关。因此这些基因表达能够作为指导原发性肝癌治疗的潜在生物标记物。即提供了一组索拉非尼耐药标记物，所述索拉非尼耐药标记物为CTNNB1或者是与CTNNB1相关联的一组标记物中的任意一种，所述与CTNNB1相关联的一组标记物为PIK3CA、HNRNPUL2-BSCL2、PAXIP1、CDKL5、LZTFL1、S1PR2、KLHL11、RP11-159G9.5、FAM171A2、ZBED6、PELI1、PRIM1。所述索拉非尼耐药标记物为RNA或其逆转录的cDNA，或蛋白。

具体筛选过程为：

发明人收集了多例原发性肝癌患者的手术标本，多点取样，通过三维培养的方法，成功建立了涵盖数百个位点的肝癌类器官生物库。团队通过苏木精-伊红(Hematoxylin-Eosin，HE)染色，证实类器官保留了患者的病理学特征。通过对类器官和对应的患者标本的免疫荧光、免疫组化染色，发现肝癌类器官与临床上肝癌患者的分子标记物也是一致的。