[发明专利]一种抗体物种的改造方法、装置、设备及存储介质

说明书

本申请实施例公开了一种抗体物种的改造方法、装置、设备及存储介质，相关实施例可应用于人工智能等各种场景，用于提高抗体物种的改造效率。该方法包括：当待改造抗体序列对应的类人指数小于指数阈值时，依次对待改造抗体序列中的每个位置上的氨基酸进行掩盖，通过人源抗体预训练模型获取每个掩盖位置对应P个第一候选类人改造氨基酸，使用每个掩盖位置对应P个第一候选类人改造氨基酸分别替换掩盖位置上的氨基酸，得到P个第一候选类人改造抗体序列，通过物种判别模型输出每个第一候选类人改造抗体序列对应的类人指数，若类人指数的最大数值大于或等于指数阈值，则将类人指数的最大数值对应的第一候选类人改造抗体序列确定为目标改造抗体序列。

技术领域

本申请实施例涉及人工智能技术领域，尤其涉及一种抗体物种的改造方法、装置、设备及存储介质。

背景技术

随着现代生物物理学、计算结构生物学以及信息技术的发展，抗体人源化设计作为一种新的研发趋势，已经成为了当今治疗性抗体研发的过程中的重要环节。

当今治疗性抗体研发的过程中，最常用的是小鼠来源的抗体，然而，小鼠产生的抗体作为药物注射入人体后，会产生强烈的免疫排斥反应，从而人体会生成“抗药抗体”(Anti-Drug Antibody，简称ADA)，如果把鼠源抗体清除出人体，会使得抗体药物无法产生相应的效果，因此，抗体人源化设计起到了至关重要的作用。

目前，抗体人源化设计通常是通过随机森林模型对抗体物种进行预测，再对抗体序列通过贪婪算法逐一进行搜索和改造，但是，在改造过程中使用的贪婪算法，必须对每个位置的氨基酸替换进行逐一穷举，需要耗费大量时间才能完成对抗体的人源化改造，从而导致改造抗体物种人源化的效率不高。

发明内容

本申请实施例提供了一种抗体物种的改造方法、装置、设备及存储介质，用于通过人源抗体预训练模型更加快速精准的定位到适合改造的氨基酸位置，并能够使用适合候选类人改造氨基酸进行改造，无需耗费大量的时间对每个位置的氨基酸替换进行逐一穷举，从而可以提高对抗体物种人源化改造的效率和合理性。

本申请实施例一方面提供了一种抗体物种的改造方法，包括：

将待改造抗体序列输入至物种判别模型，通过物种判别模型输出待改造抗体序列对应的类人指数；

当待改造抗体序列对应的类人指数小于指数阈值时，依次对待改造抗体序列中的每个位置上的氨基酸进行掩盖，得到每个掩盖位置对应的第一掩盖抗体序列；

将每个掩盖位置对应的第一掩盖抗体序列输入至人源抗体预训练模型，通过人源抗体预训练模型获取每个掩盖位置对应P个第一候选类人改造氨基酸，其中，P为大于0的整数；

使用每个掩盖位置对应P个第一候选类人改造氨基酸分别替换掩盖位置上的氨基酸，得到每个掩盖位置对应的P个第一候选类人改造抗体序列；

将每个掩盖位置对应的P个第一候选类人改造抗体序列分别输入至物种判别模型，通过物种判别模型输出每个第一候选类人改造抗体序列对应的类人指数；

若类人指数的最大数值大于或等于指数阈值，则将类人指数的最大数值对应的第一候选类人改造抗体序列确定为目标改造抗体序列，并将目标改造抗体序列对应的掩盖位置标记为已改造位置；

若类人指数的最大数值小于指数阈值，则重返依次对待改造抗体序列中的每个位置上的氨基酸进行掩盖，得到每个掩盖位置对应的第一掩盖抗体序列的步骤继续执行，直到类人指数的最大数值大于或等于指数阈值为止。

本申请另一方面提供了一种多抗体物种的改造装置，包括：

获取单元，用于将待改造抗体序列输入至物种判别模型，通过物种判别模型输出待改造抗体序列对应的类人指数；