[发明专利]一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其应用，所述花型包括铃型、蔷薇型，本发明通过在突变位点附近引入错配碱基而衍生出dCAPs标记，该标记具有共显性、位点特异、操作简单和成本低等优点，在品种分类和分子标记辅助育种中得到了广泛的应用。开发的dCAPs标记，在突变碱基处通过引入错配碱基G，获得SalI‑HF限制性内切酶位点，可对自然群体和杂交群体不同花型资源进行准确鉴定，准确率100％。通过开发的与花型性状相关的dCAPs标记，在表型与基因型验证中一致，可以作为一个分子标记，用于杂种后代分子标记辅助早期选择，对初步筛选不同花型桃种质资源具有重要的科学意义和经济价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记及其应用。

背景技术

桃(Prunus persica)属于蔷薇科(Rosaceae)李属(Prunus)，不仅果实营养丰富，还具有重要的观赏价值。桃花型分为铃形(Non-showy)和蔷薇形(Showy)，受一对等位基因SH/sh控制，铃形(SH)对蔷薇形(sh)为显性。位于Chr8上的PpB3-1基因是花型的候选基因，参与花瓣发育，促进花瓣增大，PpB3-1启动子区域的SNP与桃的花型性状高度相关。

马瑞娟等对507个栽培桃资源花型进行调查分析，发现铃型花资源79个，占15.6％，蔷薇型花资源428个，占比84.4％，说明栽培桃品种以蔷薇型花为主。 Chaparro等通过9个F₂分离群体对桃花型性状的遗传规律进行分析，F₂后代中铃型花与蔷薇型花的分离比为3∶1，符合孟德尔遗传规律，为质量性状。Fan等将该性状作为一个形态学标记锁定在桃第8号连锁群上，位于标记CPPT006与 PacC13之间。Micheletti等对1580份桃种质资源进行GWAS分析，发现位于第 8号连锁群上有18个SNP标记与花型性状紧密相关，范围为4.3Mb。随后Cao 等利用GWAS分析发现位于第8号连锁群13,740,117 bp处存在一个与花型性状关联度较高的SNP位点。本团队对‘黄水蜜’(sh)和‘中油桃14号’(SH)F₁杂交群体后代进行GWAS分析，发现位于PpB3-1基因启动子区域的一个SNP关联度最高，并通过测序发现该SNP位点与花型性状共分离，且 PpB3-1(Pp08G015510)基因在不同花型的花瓣中差异表达，将PpB3-1基因确定为桃花型性状候选基因。

目前，在公开号为CN 107893125 A的中国发明专利中，公开了一种用于鉴定桃花铃型/蔷薇型性状的单核苷酸多态性标记位点，利用SNP分子标记将桃花铃型/蔷薇型性状进行区分，虽然区分度能够平均达到95.99％，但是从公开的内容来看，对有些品种的预测准确率为90％，也就是说有可能预测失败，这样就对于一些难以区分的品种进行细分存在一定的问题。同时，CN 107893125 A的中国发明专利中需要进行测序，且成本较高，本专利采用的是dCAPs标记，PCR产物经过酶切后，利用聚丙烯安凝胶电泳就可以进行检测，成本较低。

发明内容

本发明的目的在于提供一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记，该标记鉴定铃型/蔷薇型的准确率为100％。

为实现上述目的，本发明的技术方案概述如下：

一种鉴定桃花型性状的dCAPs分子标记，其特征在于，扩增所述分子标记的引物对的上游引物序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物序列如SEQ ID NO.2 所示，所述花型包括铃型、蔷薇型。

上述dCAPs分子标记在鉴定或辅助鉴定桃花铃型/蔷薇型性状以及辅助选择育种方面中的应用。

另外，包含上述引物对的试剂盒，可以用来鉴定桃花型性状，具体应用时，可以选择含有上述分子标记引物对的试剂做成试剂盒。

利用本发明的分子标记，可以对桃花型基因进行定位，上述这些应用均可以按照常规的方法进行。