[发明专利]一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法在审
申请号: | 202210538812.6 | 申请日: | 2022-05-18 |
公开(公告)号: | CN114965984A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 邹海民;周琛;王东生;王秋菊;谢尧琪;贺巧;罗皓;杨杰 | 申请(专利权)人: | 四川省肿瘤医院 |
主分类号: | G01N33/533 | 分类号: | G01N33/533;G01N33/569;G01N33/58;C12N15/115;C12Q1/682;G01N21/64 |
代理公司: | 成都环泰专利代理事务所(特殊普通合伙) 51242 | 代理人: | 李辉;李斌 |
地址: | 610000 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 发夹 dna 级联 组装 反应 荧光 传感器 制备 方法 | ||
1.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、制备第一级催化发夹自组装反应体系(CHA);
S2、制备第二级杂交链式反应体系(HCR);
S3、荧光标记杂交链式反应中HP3链;
S4、形成荧光传感器。
2.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S1当中的第一级催化发夹自组装反应由以下步骤制备而成:Trigger链、HP1链和HP2链混合,其中Trigger链、HP1和HP2链的浓度比为1-2:1:1。
3.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S2当中的第二级杂交链式反应由以下步骤制备而成:所述S1当中的反应产物、HP3链和HP4链混合,其中HP3链和HP4链的浓度比为1:1~2:1。
4.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S3中,HP3链的臂部标记荧光基团和猝灭基团。
5.根据权利要求 1—4任一所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S3当中形成荧光传感器为:幽门螺杆菌的核酸适配体链Aptamer、Trigger链、HP1链、HP2链、HP3链和HP4链在selection buffer中形成荧光传感器。
6.根据权利要求 1—5任一所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:幽门螺杆菌的核酸适配体DNA sequences(5’-3’);
Trigger链的基因序列为:
GTAGCTGGATCTCGTCGATACACG;
HP1链的基因序列为:
CGTGTATCGACGAGATCCAGCTACTACACCAACGACGCTGGATCTCGTCGAGCCGAAAC;
HP2链的基因序列为:
ATCCAGCGTCGTTGGTGTAGTAGCTGGATCTCGTCGACTACACCAACGACG;
HP3链的基因序列为:
GCCG/Cy3/AAACGAGTCACTGTTT/BHQ2/CGGCTCGACGAG;
HP4链的基因序列为:
AGTGACTCGTTTCGGCCTCGTCGAGCCGAAAC。
7.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器,其特征在于:该荧光传感器由权利要求1-6任一所述的方法制备而成。
8.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器检测幽门螺杆菌的方法,其特征在于:该方法将权利要求1-7任一所述的方法制备的荧光传感器用于检测幽门螺杆菌菌体。
9.根据权利要求8所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器检测幽门螺杆菌的方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:
首先、根据权1-7任一所述的方法制备基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器;
接着、将不同浓度的幽门螺杆菌各自在S4的荧光传感器中反应,分别测试荧光传感器的荧光强度,构建标准曲线,得到线性方程;
最后、将待测幽门螺杆菌菌体的样液在S4制备的荧光传感器中反应,采用荧光光谱仪测定其荧光发射光谱,根据标准曲线或者线性方程,计算幽门螺杆菌的含量,判断是否含有幽门螺杆菌。
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