[发明专利]一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法在审

专利信息
申请号: 202210538812.6 申请日: 2022-05-18
公开(公告)号: CN114965984A 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 邹海民;周琛;王东生;王秋菊;谢尧琪;贺巧;罗皓;杨杰 申请(专利权)人: 四川省肿瘤医院
主分类号: G01N33/533 分类号: G01N33/533;G01N33/569;G01N33/58;C12N15/115;C12Q1/682;G01N21/64
代理公司: 成都环泰专利代理事务所(特殊普通合伙) 51242 代理人: 李辉;李斌
地址: 610000 四川*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 发夹 dna 级联 组装 反应 荧光 传感器 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、制备第一级催化发夹自组装反应体系(CHA);

S2、制备第二级杂交链式反应体系(HCR);

S3、荧光标记杂交链式反应中HP3链;

S4、形成荧光传感器。

2.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S1当中的第一级催化发夹自组装反应由以下步骤制备而成:Trigger链、HP1链和HP2链混合,其中Trigger链、HP1和HP2链的浓度比为1-2:1:1。

3.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S2当中的第二级杂交链式反应由以下步骤制备而成:所述S1当中的反应产物、HP3链和HP4链混合,其中HP3链和HP4链的浓度比为1:1~2:1。

4.根据权利要求1所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S3中,HP3链的臂部标记荧光基团和猝灭基团。

5.根据权利要求 1—4任一所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:所述S3当中形成荧光传感器为:幽门螺杆菌的核酸适配体链Aptamer、Trigger链、HP1链、HP2链、HP3链和HP4链在selection buffer中形成荧光传感器。

6.根据权利要求 1—5任一所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器的制备方法,其特征在于:幽门螺杆菌的核酸适配体DNA sequences(5’-3’);

Trigger链的基因序列为:

GTAGCTGGATCTCGTCGATACACG;

HP1链的基因序列为:

CGTGTATCGACGAGATCCAGCTACTACACCAACGACGCTGGATCTCGTCGAGCCGAAAC;

HP2链的基因序列为:

ATCCAGCGTCGTTGGTGTAGTAGCTGGATCTCGTCGACTACACCAACGACG;

HP3链的基因序列为:

GCCG/Cy3/AAACGAGTCACTGTTT/BHQ2/CGGCTCGACGAG;

HP4链的基因序列为:

AGTGACTCGTTTCGGCCTCGTCGAGCCGAAAC。

7.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器,其特征在于:该荧光传感器由权利要求1-6任一所述的方法制备而成。

8.一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器检测幽门螺杆菌的方法,其特征在于:该方法将权利要求1-7任一所述的方法制备的荧光传感器用于检测幽门螺杆菌菌体。

9.根据权利要求8所述的一种基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器检测幽门螺杆菌的方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:

首先、根据权1-7任一所述的方法制备基于发夹DNA链的级联DNA组装反应的荧光传感器;

接着、将不同浓度的幽门螺杆菌各自在S4的荧光传感器中反应,分别测试荧光传感器的荧光强度,构建标准曲线,得到线性方程;

最后、将待测幽门螺杆菌菌体的样液在S4制备的荧光传感器中反应,采用荧光光谱仪测定其荧光发射光谱,根据标准曲线或者线性方程,计算幽门螺杆菌的含量,判断是否含有幽门螺杆菌。

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