[发明专利]基于质谱流式技术的胰腺癌筛查模型的建立方法在审

专利信息
申请号: 202210467183.2 申请日: 2022-04-27
公开(公告)号: CN114936449A 公开(公告)日: 2022-08-23
发明(设计)人: 梁廷波;章琦;叶茅 申请(专利权)人: 浙江大学医学院附属第一医院
主分类号: G06F30/20 分类号: G06F30/20;G06K9/62;G16H50/70
代理公司: 北京盛凡佳华专利代理事务所(普通合伙) 11947 代理人: 张欢
地址: 310000 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 基于 质谱流式 技术 胰腺癌 模型 建立 方法
【说明书】:

发明公开了一种基于质谱流式技术的胰腺癌筛查模型的建立方法,涉及医疗领域。本发明包括以下步骤:用Ficoll分离法处理外周血样获得PBMC,并对PBMC进行质谱流式分析,获得流式分析数据集;通过随机森林算法处理流式分析数据集,以细胞表面标志物阴性比例和亚群比例作为建模特征,进行特征筛选,得到胰腺癌筛查模型。本发明可用于胰腺癌的筛查及辅助诊断。

技术领域

本发明涉及医疗领域,更具体的说是涉及一种基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法。

背景技术

胰腺癌起病隐匿,进展迅速,相当比例的患者在初诊时就失去了手术根治性切除的机会,预后并不乐观。有报道,肿瘤局限于导管上皮且小于1cm的患者术后5年生存率可达100%。然而,只有15-20%的患者在首次诊断时有机会接受治疗性手术。目前用于临床诊断胰腺癌的生物标志物是糖类抗原CA19-9。但Lewis抗原阴性的人群很少或不分泌CA19-9。且部分胆道梗阻、炎症、胰腺炎等胃肠道肿瘤患者也伴有CA19-9水平升高,导致假阳性结果。因此,仍迫切需要开发新的有效的胰腺癌筛查生物标志物。

新兴的液体活检主要涉及循环肿瘤DNA(ctDNA)、细胞游离DNA (cfDNA)、细胞游离rna(如mRNAs、microRNAs)、循环肿瘤细胞(CTCs)和外泌体的检测。这些策略在肿瘤检测领域显示了其优势和潜力。然而,目前还没有被广泛接受的液体活检方法来检测肿瘤。

免疫系统与人体的健康状态有着极为紧密的联系。个体免疫系统水平可影响肿瘤的发生、发展和预后。近年来,新出现的研究表明,肿瘤进展过程中个体免疫系统发生了系统性的变化,其中部分变化可能反映在外周血中。既往研究综述肿瘤负荷宿主的造血功能广泛受损,外周血中不成熟的中性粒细胞和单核细胞异常扩张,部分转移至肿瘤微环境,导致局部免疫抑制。因此通过全面细致的监测人体外周免疫状态或能为疾病的预防、诊断和治疗提供极大的帮助。近年来,质谱流式技术逐渐完善,可以高维度得分析人体基础免疫状态,获得全方位的免疫细胞构成、表型和功能信息。

发明内容

有鉴于此,本发明提供了一种基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法,可用于胰腺癌的筛查及辅助诊断。

为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:

一种基于质谱流式技术的胰腺癌筛查模型的建立方法,包括以下步骤:

用Ficoll分离法处理外周血样获得PBMC,并对PBMC进行质谱流式分析,获得流式分析数据集;

通过随机森林算法处理流式分析数据集,以细胞表面标志物阴性比例和亚群比例作为建模特征,进行特征筛选,得到胰腺癌筛查模型。

可选的,还包括筛选出1个细胞表面标志物CD33和18个免疫细胞亚群包括CD14-CD33-CD3+CD8+CD27-、CD14-CD33-CD3+CD8+CD85j+、 CD14-CD33-CD3-CD19-CD20-CD56+CD94-、CD3-CD19-CD56-HLA-DR-、 CD14-CD33-CD3+CD4+、CD14-CD33-CD3+CD4+HLA-DR-CD38+、 CD14-CD33-CD3+CD8+、CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR+、 CD14-CD33-CD3+CD8+CCR7+CD45RA+、 CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR-CD38+、 CD14-CD33-CD3+CD8+HLA-DR+CD38+、CD14-CD33-CD3+HLA-DR+、 CD14-CD33-CD3+CD56+、CD14-CD33-CD19+IgD+CD27+、 CD14-CD33-CD3-CD56+CD16+HLA-DR+、CD3-CD19-CD14+、 CD14-CD16+HLA-DR+、CD3-CD19-CD56-HLA-DR-CD33+CD11b+。

可选的,还包括采用内部验证集、外部验证集验证模型。

可选的,还包括结合受试者血清CA19-9,构建整合胰腺癌筛查模型。

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