[发明专利]基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法在审
| 申请号： | 202210458107.5 | 申请日： | 2022-04-27 |
| 公开（公告）号： | CN114937493A | 公开（公告）日： | 2022-08-23 |
| 发明（设计）人： | 梁廷波;章琦;叶茅 | 申请（专利权）人： | 浙江大学医学院附属第一医院 |
| 主分类号： | G16H50/20 | 分类号： | G16H50/20;G16B40/00;G01N15/14;G01N33/574;G01N33/68 |
| 代理公司： | 北京盛凡佳华专利代理事务所(普通合伙) 11947 | 代理人： | 张欢 |
| 地址： | 310000 浙*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 基于 质谱流式 技术 肝癌 模型 建立 方法 | ||
1.一种基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法，其特征在于，包括以下步骤：
用Ficoll分离法处理外周血样获得PBMC，并对PBMC进行质谱流式分析，获得流式分析数据集；
通过随机森林算法处理流式分析数据集，以细胞表面标志物阴性比例和亚群比例作为建模特征，进行特征筛选，得到肝癌筛查模型。
2.根据权利要求1所述的一种基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法，其特征在于，特征筛选具体为：根据特征最高得分选择特征，从阴性、阳性样本中分别随机选择300例样本，建立随机森林模型，并且采用10折交叉验证方法，得到每个特征的平均特征重要性，重复1000次，则每个特征都会有1000个特征重要性值，统计每个特征的特征重要性大于0.01的个数，如果大于400，则该特征被选择，被选择的特征作为建模需要的特征。
3.根据权利要求1所述的一种基于质谱流式技术的肝癌筛查模型的建立方法，其特征在于，还包括筛选出13个细胞表面标志物包括CD14、CD152、CD183、CD25、CD278、CD33、CD39、CD4、CD45RA、CD56、CD85j、CD86、CD8α，以及16个细胞亚群包括Myeloid cells/HLA-DR-、Lymphocytes/CD3+/CD4+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/ICOS+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/CD197+,CD45RA+、Lymphocytes/CD3+/CD4+/CD197-,CD45RA-、HLA-DR+CD38+CD4+T cells、Lymphocytes/CD3+/CD4+/HLA-DR-,CD38-、Lymphocytes/CD3+/CD4+/Tfh(CD185+CD279+)、Lymphocytes/CD3+/CD8+、Lymphocytes/CD3+/CD8+/CXCR5+、Lymphocytes/CD3+/CD8+/CD197+,CD45RA+、Lymphocytes/CD3-/Bcells/IgD+,CD27+、Lymphocytes/CD3-/CD56+CD16+/HLA_DR+、Monocytes、Myeloid cells/HLA-DR-/MDSC。
4.根据权利要求1所述的一种基于质谱流式技术的癌症筛查模型的建立方法，其特征在于，还包括采用内部验证集、外部验证集验证模型。
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