[发明专利]一种真菌微生物组作为胃癌诊断的标志物的应用

权利要求书

1.一种真菌微生物组作为胃癌诊断的标志物的应用，其特征在于，所述真菌微生物组包含Cystobasidium,Cutaneotrichosporon,Apodus,Apiotrichum,Simplicillium,Lecanactis,Rhizopus,Rhodotorula,Exophiala和Sarocladium中的任意一种或几种的组合，其中，真菌微生物为真菌中门水平、属水平以及种水平中的一种或以上。

2.权利要求1所述的标志物的应用，其特征在于，所述真菌微生物的筛选方法为：通过提取组织中的DNA，进行ITS测序和读数分类学注释，判断胃癌患者与健康对照之间的所述真菌微生物的差异度和/或相似性，得到真菌微生物标志物。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述组织包括胃癌组织、癌旁组织和健康胃组织。

4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述ITS测序的过程为：

(1)提取组织中的DNA；

(2)使用ITS引物进行建库和PCR扩增；

(3)使用NanoDrop 2000紫外分光光度计和1％的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物的浓度和纯度；

(4)利用Illumina MiSeqPE 300测序仪进行测序。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，步骤(2)中的ITS引物为：

上游引物ITS3F：GCATCGATGAAGAACGCAGC，

下游引物ITS4R：TCCTCCGCTTATTGATATGC。

6.根据权利要4所述的应用，其特征在于，所述的读数分类学注释过程为：

(1)删除错配、缺失和重复的序列，只允许2个核苷酸错配；

(2)使用UPARSE.7将相似性97％以上的分类单元(OTU)聚集为相同OTU；

(3)使用QIIME计算α多样性，包括chao1、物种和PD_whole_tree；

(4)使用LefSe方法对GC和HC组差异表达的真菌进行分析。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，使用受试者工作曲线ROC分析真菌标志物，分析工具为Excel和Graphpad 8.0。

8.一种用于胃癌诊断的试剂盒，其特征在于，包含能够检测出权利要求1所述的标志物所属真菌的试剂。