[发明专利]编辑RNA的融合蛋白及其应用在审
| 申请号: | 202210419197.7 | 申请日: | 2022-04-20 |
| 公开(公告)号: | CN114685685A | 公开(公告)日: | 2022-07-01 |
| 发明(设计)人: | 池天;吕君君;邸明慧;荆征宇 | 申请(专利权)人: | 上海科技大学 |
| 主分类号: | C07K19/00 | 分类号: | C07K19/00;C12N15/113;C12N15/62;C12N15/85;C12N5/10;A61K47/26;A61K47/42 |
| 代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 水文钰;黄益澍 |
| 地址: | 201210 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 编辑 rna 融合 蛋白 及其 应用 | ||
1.一种融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白自N端至C端依次包括:单链RNA结合蛋白片段、RNA发夹结合蛋白片段、出核信号肽片段和脱氨酶片段;所述脱氨酶片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:99所示。
2.如权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白的N端和/或C端还连接有富含组氨酸结构域片段,所述富含组氨酸结构域片段的拷贝数为大于等于1的自然数,优选为1、2、3或4;
较佳地,所述富含组氨酸结构域片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。
3.如权利要求1或2所述的融合蛋白,其特征在于,所述单链RNA结合蛋白片段、RNA发夹结合蛋白片段、出核信号肽片段和脱氨酶片段之间通过连接子连接;和/或,所述脱氨酶片段和所述富含组氨酸结构域片段之间通过连接子连接;和/或,一个以上拷贝的所述富含组氨酸结构域片段之间通过连接子连接;
较佳地,所述连接子为(GmS)n或如SEQ ID NO:97、98或100所示的氨基酸序列;其中,m和n分别为0或正整数,且不同时为0,例如(G2S)6、(GS)3;
更佳地,所述单链RNA结合蛋白片段与所述RNA发夹结合蛋白片段之间通过(G2S)6连接;和/或,所述RNA发夹结合蛋白片段与所述出核信号肽片段之间通过如SEQ ID NO:97所示的氨基酸序列连接;和/或,所述出核信号肽片段与所述脱氨酶片段之间通过串联的连接子连接,所述串联的连接子优选由EF和如SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列串联;和/或,所述脱氨酶片段和所述富含组氨酸结构域片段之间通过(GS)3连接;和/或,一个以上拷贝的所述富含组氨酸结构域片段之间通过如SEQ ID NO:100所示的氨基酸序列连接。
4.如权利要求1~3任一项所述的融合蛋白,其特征在于,所述单链RNA结合蛋白片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:38所示;
和/或,所述RNA发夹结合蛋白片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:96所示;
和/或,所述出核信号肽片段的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
5.一种碱基编辑系统,其特征在于,所述碱基编辑系统包括引导RNA和如权利要求1~4任一项所述的融合蛋白;
较佳地,所述引导RNA包括骨架结构和识别结构;所述骨架结构包含至少一个发夹结构,优选包含2个发夹结构;
更佳地,所述发夹结构的转录模板具有如SEQ ID NO:101所示的核苷酸序列;和/或,所述识别结构的长度为30nt。
6.一种分离的多核苷酸,其特征在于,所述多核苷酸编码如权利要求1~4任一项所述的融合蛋白或如权利要求5所述的碱基编辑系统。
7.一种表达盒,其特征在于,所述表达盒包括启动子和如权利要求6所述的多核苷酸;
较佳地,所述启动子为U6启动子,优选为人源U6启动子;
更佳地,所述表达盒的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
8.一种构建体,其特征在于,所述构建体包含如权利要求6所述的多核苷酸或如权利要求7所述的表达盒;
较佳地,所述构建体选自细菌构建体、真菌构建体、动物细胞构建体和植物细胞构建体。
9.一种表达系统,其特征在于,所述表达系统为表达如权利要求8所述的构建体的宿主细胞;
较佳地,所述宿主细胞为真核细胞或原核细胞;
更佳地,所述真核细胞为人细胞系或鼠源细胞,优选地为人肾上皮细胞系或鼠脑神经瘤细胞,例如HEK293T或N2A。
10.一种药物组合物,其特征在于,所述药物组合物包括如权利要求1~4任一项所述的融合蛋白或如权利要求5所述的碱基编辑系统,以及药学上可接受的载体。
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