[发明专利]一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法

权利要求书

1.一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1、获取原始数据；所述原始数据包括：FLASH照射组织的蛋白质表达丰度数据、常规放疗照射的蛋白质表达丰度数据和无任何照射的蛋白质表达丰度数据；

S2、对所述原始数据进行预处理；对预处理后的所述原始数据进行差异表达蛋白分析，得到三组差异表达蛋白；所述三组差异表达蛋白包括：FLASH照射组对比常规照射组、FLASH照射组对比对照组和常规照射组对比对照组；所述FLASH照射组由所述FLASH照射组织的蛋白质表达丰度数据组成；所述常规照射组由所述常规放疗照射的蛋白质表达丰度数据组成；所述对照组由所述无任何照射的蛋白质表达丰度数据组成；

S3、分别对所述三组差异表达蛋白以及所述三组差异表达蛋白的并集进行蛋白质相互作用网络构建，生成四个网络；分别对所述四个网络进行模块划分，筛选出重要模块；所述重要模块的筛选由模块所含蛋白的数量、所含蛋白的种类，以及与FLASH作用机制相关的重要蛋白数量决定；

S4、对所述FLASH照射组对比对照组以及所述常规照射组对比对照组的两组差异表达蛋白进行亚细胞定位分析；获取所述亚细胞定位分析的结果与所述重要模块之间的对应关系，完成FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析。

2.如权利要求1所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述步骤S2还包括：

分别对所述三组差异表达蛋白进行基因本体论功能富集分析和KEGG通路富集分析，并对分析结果进行可视化。

3.如权利要求2所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述步骤S3还包括：

对所述三组差异表达蛋白所构建的网络分别进行拓扑学和生物学分析；所述拓扑学分析包括：对蛋白节点的度和聚类系数进行分析；所述生物学分析包括：对基因本体论功能富集分析结果、KEGG通路富集分析结果、组织表达结果和蛋白结构域结果进行分析；

对所述KEGG通路富集分析结果进行可视化，与网络构建之前的所述三组差异表达蛋白的KEGG通路富集分析的可视化结果进行对比，获取网络构建前后KEGG通路富集分析结果的差异。

4.如权利要求1所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述步骤S3还包括：

分别对所述重要模块进行KEGG通路富集分析并可视化；

确定所述重要模块的功能，筛选出所述重要模块中功能相同的重要模块；

获取所述功能相同的重要模块之间的蛋白蛋白相互作用并可视化；

将所述功能相同的重要模块合并为Robust模块。

5.如权利要求4所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述确定重要模块的功能，包括：

分别对比所述三组差异表达蛋白的并集所建网络的重要模块及其KEGG通路富集分析结果，以及所述三组差异表达蛋白分开所建网络的重要模块及其KEGG通路富集分析结果，确定所述重要模块的功能。

6.如权利要求5所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述确定重要模块的功能，还包括：

对无法确定功能的所述重要模块，通过基因本体论功能富集分析查看生物学过程，来辅助确定所述重要模块的功能。

7.如权利要求1所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，所述步骤S4还包括：

对所述亚细胞定位分析的结果中两组差异表达蛋白处于同一亚细胞定位的蛋白进行KEGG通路富集分析；所述两组差异表达蛋白为：FLASH照射组对比对照组，以及常规照射组对比对照组。

8.如权利要求1所述的一种FLASH照射组织的定量蛋白质组学分析方法，其特征在于，还包括：

S5、对FLASH照射组对比对照组以及常规照射组对比对照组的两组差异表达蛋白进行无序蛋白分析。