[发明专利]一种前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法

权利要求书

1.一种前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，包括：

获取前列腺穿刺样本，所述前列腺穿刺样本包括N个正常前列腺穿刺样本、N个激素敏感性前列腺癌穿刺样本和N个激素抵抗性前列腺癌穿刺样本；其中，N为大于1的正整数；

对所述前列腺穿刺样本进行MeRIP-Seq甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序，并采用差异分析方法分析所述前列腺穿刺样本中与前列腺癌预后相关的基因，得到与前列腺癌预后相关的若干个m6A修饰基因；

将所有所述m6A修饰基因作为训练集，采用回归分析筛选出与前列腺癌预后风险预测相关的若干个关键基因；

根据所有所述关键基因构建前列腺癌患者预后风险预测模型，通过所述预后风险预测模型得到所述前列腺癌患者的预后风险情况。

2.如权利要求1所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述通过所述预后风险预测模型得到所述前列腺癌患者的预后风险情况，具体包括：

通过所述预后风险预测模型得到每一所述关键基因的表达量和相关系数；其中，所述相关系数为所述关键基因与所述前列腺癌患者预后的相关系数；

根据所述表达量和所述相关系数计算所述前列腺癌患者预后的风险评分；

根据所述风险评分得出所述前列腺癌患者的预后风险情况。

3.如权利要求2所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述风险评分的计算公式为：

其中，RS表示风险评分，n表示关键基因的数量，a_i表示第i个关键基因的相关系数，exp_i表示第i个关键基因的表达量。

4.如权利要求2所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述根据所述风险评分得出所述前列腺癌患者的预后风险情况，具体包括：

判断所述风险评分是否超出预设范围；

若所述风险评分超出预设范围，则说明所述前列腺癌患者的预后风险较高；

若所述风险评分未超出预设范围，则说明所述前列腺癌患者的预后风险较低。

5.如权利要求1所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述方法还包括：

采用Kaplan–Meier生存分析、ROC分析和C-index中的一种或多种对所述预后风险预测模型的预测准确性进行验证。

6.如权利要求1所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述回归分析为岭回归分析、Cox回归分析、Lasso回归分析或ElasticNet回归分析中的任意一种。

7.如权利要求1至6中任一项所述的前列腺癌患者预后风险预测模型的构建方法，其特征在于，所述关键基因分别为THSD7A、TNFRSF12A、CELSR3、NFIX、SYT7、GPRC5A、IGF1、HGF、ANK1、VCAN、CDH1、ADRB1、HDAC9、COL9A2、KITLG、LAMA3、TMCC3、LAMC2、GNA15、CDH3、GPC1、NGEF、SYT1、ATP11A、ADD2、FDFT1、OPRK1、RPS5、WNT11、LYZ、SLC5A1、NEFH、CHGA、MMP9、MYBL2、EEF1A2、PTK6、SMS、KLF5、MMP15、SLC7A5、CPPED1、PLAT、EIF3E、NDRG1、NCALD、BNIP3L、MYH14、COMP、LFNG、CASP2、SFRP4、AEBP1、RLN1、SH3PXD2A、SOD3、FAM149A、CUX2、OAS3、RIC8B、COL12A1、FRK、BVES、SLC16A10、PDE10A、MDFI、ENPP5、MRPS27、PCDHB3、PCDHB5、PCDHB7、QPCT、SDC1、ST6GALNAC5、GBP3、F3、SPP1、GALNT12、PLEKHG1、SOCS2、GLIPR2、NUDT10、LRP1、HJURP、SDC4、SOX9、C3、IFI6、ZC4H2、HIP1、STEAP4、CDC42EP1、ISLR、PGAP6、PPP1R1B、MCCC2、SLC6A11、PPARG、VSTM2L、ATP8A2、CHI3L1、KL、AMPD3、BHLHE40、HMGCS2、LDHA、ANXA1、GOLM1、ELF5、CKAP2、TTYH3、DAB2IP、KIF12、MYC、RPS6、RNF144B、GGH、SORL1、ITGA11、CYP1B1、SLC39A8、SORD、CPNE2、SLC39A6、MAPK4、PFKL、RPS8、ZNF697、GULP1、IL17RD、PLA1A、ADPRH、RPS3A、OTULINL、CXCL14、TNFRSF21、SDK1、CSGALNACT1、RPL7、CDKN2A、LCN2、FAM171A1、FAM13C、ADD3、ADM、ITPR1、ANK3、PLEKHG4B、AK5、ANKRD29、PDLIM3、SLC16A1、MMP14、ERG、CLSTN2、RUNX1、SPON2、RPL8、DMKN、RPL26、CAMK2N1、C1orf115、PIGR、CLDN1、ELF3、RPL22L1、CDCP1、ARHGEF3、GUCY1A1、HHIP、FABP5、CTSB、WNK2、SLC16A9、GJB2、PKNOX2、GREM1、C19orf48、KRT80、DDIT4、ZNF608、VXN、PARM1、PFKFB3、KCNK3、KRT19、RRM2、RARG、DMXL1、AGR3、PTPRM、CHST2、UCP2、DMRTA1、RIMS2、RPS27、ADAMTSL1、VWA1、SLITRK4、ALOX15B、BACE2、CACNB4、ANXA2、CRIP2、CCSER1、SEPTIN9、SFTPA2、MUC1、THBS2、KRT10、ZNF395、ISG15、FYB2、AGRN、PLA2G2A、DPYD、APOD、NTNG2、ESRRG、SPTSSB、MME、TLE1、TMEM26、SERPINA1、S100A10、RPL12、ELOVL2、HLA-DRB5、RYR2、SCAMP5、COL5A2、VGLL3、LBH、S1PR3、EML6、RPS18、TMEM150C、RPL17和PCDHB16。