[发明专利]一种测量少量细胞翻译组的方法及其应用

权利要求书

1.一种测量少量细胞翻译组的方法，其特征在于，包括：

1）分别提取两个目标物种的靶细胞的多聚核糖体mRNA，并测序获得混合RNA-seq测序结果；

2）通过与目标物种的基因组的比对分析，去除所述混合RNA-seq测序结果中的同源基因数据，分别获得每个目标物种的特有读长（specific reads）；

3）将两个目标物种的特有读长混合，通过抽样和合并，获得混合样品读长（reads），所述混合样品读长包括第一物种混合读长mix read1和第二物种混合读长mix read2；

4）将第一物种混合读长mix read1与第一物种基因组比对，获得第一比对结果；

将第二物种混合读长mix read2与第二物种基因组比对，获得第二比对结果；

5）通过对第一比对结果和第二比对结果的定量分析和注释，获得鉴定出靶细胞中正在翻译的mRNA。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述目标物种均为哺乳动物。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述靶细胞数为10⁴~10⁵。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤3）中，所述特有读长的的混合为将其中第一物种的特有读长设置为由1%以1%的梯度递增到10%的10组，第二物种的特有读长为100%。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤3）中，所述抽样是无放回随机抽样以确定所得混合样品所占比例。

6. 如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤3）中所述第一物种混合读长mix read1和第二物种混合读长mix read2是通过包括下述的步骤获得的：

分别将第一物种和第二物种的特有读长的read name进行无放回随机抽样，获得抽样read name ID,再根据抽样read name ID从特有读长提取对应的reads，分别获得第一物种和第二物种各自的抽样read1 和read2，最后将抽样出来的第一物种的read1与第二物种的read1合并，第一物种的read2与第二物种的read2合并，得到混合样品读长（reads）、第一物种混合读长mix read1和第二物种混合读长mix read2。

7.如权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤４）中利用STAR将mix read1、mix read2分别与基因组进行比对。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法在鉴定翻译中mRNA中的应用。