[发明专利]一种与母猪繁殖性状有关的分子标记及筛选方法和应用

说明书

本发明涉及一种与母猪繁殖性状有关的分子标记及筛选方法和应用，涉及猪遗传基因技术领域。该分子标记为SNP分子标记，位于猪1号染色体96673697bp位置或猪10号染色体58587289bp位置，猪参考基因组为Sscrofa11.1；猪1号染色体96673697bp位置为CT突变的突变位点，猪10号染色体58587289bp位置为CT突变的突变位点。该分子标记不同基因型母猪的繁殖性状有极显著的差异，根据该分子标记选留母猪，能够留用产仔总数和活仔总数高的母猪，有利于改善母猪的繁殖性状，提高母猪的产仔性能。

技术领域

本发明涉及猪遗传基因技术领域，特别是涉及一种与母猪繁殖性状有关的分子标记及筛选方法和应用。

背景技术

我国养猪历史悠久，而养猪的终端产品主要是猪肉，是日常生活中最常见的肉制品，产量位于肉制品之首。在实际育种工作中，产总仔数和产活仔数是评定母猪生产最重要的指标，同时也是母猪重要的繁殖性状和经济性状之一，直接影响猪场的经济效益。影响母猪繁殖性能的因素有品种、年龄、环境、饲养管理、激素水平、营养和遗传，其中遗传是主要因素，规模化猪场要挑选出繁殖性能较高的优良品种进行繁育。

猪的繁殖性状是由多基因控制，使用传统的QTL定位法具有适合稀有基因的研究并且群体可控制，目的性和结果预期性强的特点，但其检测到的QTL个数有限，只涉及到分离群体中双亲存在差异的位点，而且无法检测到复等位基因和定位分辨率低。这种方法的较适合用于检测重组事件少的人为杂交构建的群体中。

如何提高母猪窝均产仔数及产仔活数，充分发挥母猪的生产性能，增加养殖场经济效益，成为了养猪生产中的重点。

发明内容

针对上述问题，本发明提供一种与母猪繁殖性状有关的分子标记，该分子标记不同基因型母猪的繁殖性状有极显著的差异，根据该分子标记选留母猪，能够留用产仔总数和活仔总数高的母猪，有利于改善母猪的繁殖性状，提高母猪的产仔性能。

为了达到上述目的，本发明提供一种与母猪繁殖性状有关的分子标记，该分子标记为SNP分子标记，所述SNP分子标记位于猪1号染色体96673697bp位置或猪10号染色体58587289bp位置，猪参考基因组为Sscrofa11.1；所述猪1号染色体96673697bp位置为CT突变的突变位点，所述猪10号染色体58587289bp位置为CT突变的突变位点。

本发明人通过对两个品种母猪（长白猪和大白猪）混合的纯种猪产仔均匀度进行全基因组关联分析，成功筛选出影响母猪繁殖性状的遗传分子标记ASGA0100031和WU_10.2_10_64348824；上述遗传分子标记ASGA0100031位于猪1号染色体96673697bp位置，而猪1号染色体96673697bp位置为CT突变的突变位点；上述遗传分子标记WU_10.2_10_64348824位于猪10号染色体58587289bp位置，而猪10号染色体58587289bp位置为CT突变的突变位点，上述分子标记的不同基因型母猪的繁殖性状有极显著差异。

即本发明公开了一种用于评估母猪繁殖性状的分子标记，可根据该分子标记评估母猪的繁殖性状，并根据评估结果留用产仔总数和活仔总数高的母猪，提高母猪的产仔性能。

本发明还公开了一种用于评价母猪繁殖性状的分子标记序列，该分子标记序列为所述突变位点的上下游100±20bp序列。

在其中一个实施例中，所述分子标记序列如下所示：

5’-TCCCCACTTCTGTAAAATGAGTAACAGCTATACTACATTGGGCTACTGTGATGATTAAATACAAGTCTTTCAGAACCAAAAAGCTTCAGGTACAGATCTG（SEQ ID NO:1）-E-ACCCCACTGTCACTGGTAGGGTTGTCTCTGAGTGGACACTTGCACGTGATGTTCTTTGAGATTTCTCAAAGGCAGGTATGAACTTATTTACAAGAACCAA -3’ （SEQ ID NO:2），其中E为突变位点；