[发明专利]利用CRISPR/dCas9敲低调控蛋白表达以提高TG酶产量的方法在审
申请号: | 202210224071.4 | 申请日: | 2022-03-07 |
公开(公告)号: | CN114457103A | 公开(公告)日: | 2022-05-10 |
发明(设计)人: | 白林泉;刘先;步建国 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;泰兴市东圣生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/76 | 分类号: | C12N15/76;C12N9/10;C12N1/21;C12N15/31;C12R1/465 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 crispr dcas9 调控 蛋白 表达 提高 tg 产量 方法 | ||
1.一种敲低调控蛋白表达以提高TG酶产量的方法,其特征在于,同时敲低茂源链霉菌C2基因组中调控蛋白编码基因SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述调控蛋白编码基因SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720的序列依次如SEQ ID NO.1、NO.2、NO.3、NO.4所示。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
S1、构建用于同时敲低SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720的CRISPR/dCas9质粒载体I;
S2、将构建得到的CRISPR/dCas9质粒载体I通过接合转移导入受体菌茂源链霉菌C2中进行特异性抑制;
S3、通过安普霉素抗性和PCR验证筛选,得到SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720敲低的突变株。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,质粒载体I的构建包括如下步骤:
A1、设计靶向抑制SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720的sgRNA的20nt序列,通过PCR扩增分别得到含有目标20nt的sgRNA片段,通过Gibson assembly与SpeI/EcoRI双酶切后的整合型质粒pSET-dCas9进行组装,得到4个分别抑制4个基因的质粒;
A2、设计通用质粒pGGA载体和4个sgRNA片段的4nt突出末端及引物,PCR扩增分别得到4个片段,将4个sgRNA片段和载体组装到一起;通过PCR将4个sgRNA片段一起扩增下来,通过Gibson assembly与EcoRI/EcoRV双酶切后的pSET-dCas9进行组装,得到同时抑制4个基因的质粒载体I。
5.权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤A1中,抑制SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720的sgRNA的20nt序列依次如SEQ ID NO.5-8所示。
6.权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤A1中,PCR扩增的引物包括:序列如SEQ IDNO.9/10所示的4150-gRNA-F/dCas9-gRNA-R、序列如SEQ ID NO.11/10所示的1792-gRNA-F/dCas9-gRNA-R、序列如SEQ ID NO.12/10所示的3072-gRNA-F/dCas9-gRNA-R、序列如SEQ IDNO.13/10所示的720-gRNA-F/dCas9-gRNA-R。
7.权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤A2中,所述引物包括序列如SEQ ID NO.14/15所示的part1-F/R、序列如SEQ ID NO.16/17所示的part2-F/R、序列如SEQ ID NO.18/19所示的part3-F/R、序列如SEQ ID NO.20/21所示的part4-F/R。
8.权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤A2中,将4个sgRNA片段一起扩增下来采用的是序列如SEQ ID NO.24/25所示的引物GGA-Gibson-F/R。
9.权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤A2中,将4个sgRNA片段和载体组装到一起形成质粒,利用序列如SEQ ID NO.22/23所示的引物pGGA-F/R通过PCR、PstI/NotI双酶切、测序验证该质粒的正确性;通过序列如SEQ ID NO.24/25所示的引物GGA-Gibson-F/R进行PCR、EcoRI/EcoRV双酶切和测序验证质粒载体I正确性。
10.一种高产谷氨酰胺转氨酶的基因工程菌,其特征在于,同时敲低茂源链霉菌C2中的调控蛋白编码基因SMDS_4150、SMDS_1792、SMDS_3072和SMDS_720,即得所述基因工程菌。
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