[发明专利]大型溞鉴定用SSR标记组合及其用途

说明书

本发明涉及浮游动物分子标记领域，特别是涉及培育种大型溞鉴定用SSR标记组合及其用途，所述培育种大型溞鉴定用SSR标记组合包括以下中的一项或多项：ZSC_320、ZSC_448、ZSC_546、ZSC_679、ZSC_748、ZSC_761、ZSC_1372、ZSC_1701、ZSC_18335、ZSC_875、ZSC_1797、ZSC_1890、ZSC_2050、ZSC_2586、ZSC_2799、ZSC_2828、ZSC_3113、ZSC_3761、ZSC_3833、ZSC_4037、ZSC_4319、ZSC_10218、ZSC_6980、ZSC_7904、ZSC_8717、ZSC_9631。本发明大型溞鉴定相关SSR标记可为评价我国大型溞品种遗传特征、大型溞品种鉴定等工作提供理论依据和技术手段。

技术领域

本发明涉及浮游动物分子标记领域，特别是涉及大型溞鉴定用SSR标记组合及其用途。

背景技术

大型溞(Daphnia magna)属于溞科(Daphniidae)、溞属(Daphnia)，是水域生态系统的重要组成物种，主要生活在淡水湖泊、河流、池塘和水库中。大型溞可直接滤食浮游植物，常用于控制水体中浮游植物的种群数量和群落结构，可一定程度上抑制微囊藻华的发生。大型溞具有分布广、适应性强、繁殖期短，可在实验室大规模培养等特点，且对水环境中多种有毒物质高度敏感，因此被广泛应用于水污染监测和水生生物毒理研究。同时也是生命科学研究领域较为理想的模式生物。

SSR(simple sequence repeats)即简单重复序列，也称为微卫星DNA(microsatellite DNA)，是一种以特异引物PCR为基础的DNA分子标记技术。它是基因组内以1～6个核苷酸为重复单元组成的短串联重复序列，广泛分布于基因组的各个区域。SSR是目前最常用的微卫星标记之一，因具有数量多、共显性、操作简便、结果稳定、多态性高、可重复性强等优点，已广泛用于基因定位、遗传图谱构建、指纹图谱分析、亲缘关系鉴定以及多样性评价等研究中。国内对于大型溞SSR标记开发的研究还鲜有报道。

发明内容

鉴于以上所述现有技术的缺点，本发明的目的在于提供大型溞鉴定用SSR标记组合及其用途，用于解决现有技术中的问题。

为实现上述目的及其他相关目的，本发明提供一种培育种大型溞鉴定用SSR标记组合，所述SSR标记包括以下中的一项或多项：ZSC_320、ZSC_448、ZSC_546、ZSC_679、ZSC_748、ZSC_761、ZSC_1372、ZSC_1701、ZSC_18335、ZSC_875、ZSC_1797、ZSC_1890、ZSC_2050、ZSC_2586、ZSC_2799、ZSC_2828、ZSC_3113、ZSC_3761、ZSC_3833、ZSC_4037、ZSC_4319、ZSC_10218、ZSC_6980、ZSC_7904、ZSC_8717、ZSC_9631。

SSR标记ZSC_320的重复单元为CAG，重复次数为6。

SSR标记ZSC_448的重复单元为TTG，重复次数为6。

SSR标记ZSC_546的重复单元为TGT，重复次数为6。

SSR标记ZSC_679的重复单元为TTG，重复次数为7。

SSR标记ZSC_748的重复单元为AAC，重复次数为7。

SSR标记ZSC_761的重复单元为AAC，重复次数为5。

SSR标记ZSC_1372的重复单元为GTT，重复次数为7。

SSR标记ZSC_1701的重复单元为CAG，重复次数为5。

SSR标记ZSC_18335的重复单元为TC，重复次数为7。

SSR标记ZSC_875的重复单元为ACC，重复次数为5。