[发明专利]一种基于无线通信的固态纳米孔基因测序数据通信方法在审
申请号: | 202210219159.7 | 申请日: | 2022-03-08 |
公开(公告)号: | CN114615567A | 公开(公告)日: | 2022-06-10 |
发明(设计)人: | 戚晨皓;李健;许利群;黄婧佳;白赟 | 申请(专利权)人: | 东南大学;中移(成都)信息通信科技有限公司 |
主分类号: | H04Q9/00 | 分类号: | H04Q9/00;H04W4/30;H04W16/10;H04W16/04;H04L67/12;G16H50/80;G16B30/00;C12Q1/6869;C12Q1/70;C12R1/93 |
代理公司: | 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 | 代理人: | 孙建朋 |
地址: | 211102 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 无线通信 固态 纳米 基因 序数 通信 方法 | ||
1.一种基于无线通信的固态纳米孔基因测序数据通信方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1、建立一个基于无线通信的固态纳米孔基因测序系统,包含至少一个便携式固态纳米孔测序装置、配置5G无线通信模组的通信装置、云平台和基站;
所述便携式固态纳米孔测序装置用于采集基因测序数据;
所述配置5G无线通信模组的通信装置和基站用于传输基因测序数据,所述云平台用于处理基因测序数据,所述基站同时用于向用户分配通信资源;
步骤2、用户提取生物样本,使用便携式固态纳米孔测序装置测序,同时将身份信息录入基于无线通信的固态纳米孔基因测序系统,并实时反馈用户通信装置本地内存占用信息;
步骤3、在配置5G无线通信模组的通信装置上将便携式固态纳米孔测序装置采集的数据压缩、加密,并通过5G技术将用户数据传输到基站,基站根据数据通信方案为用户分配通信资源;
步骤4、在云平台存储用户上传的基因测序数据,利用算法模块,对测序数据进行分析处理,并根据处理结果,按照数据通信方案对用户通信资源分配权重进行实时动态调整;
步骤5、云平台生成检测报告,将检测报告返回给用户。
2.根据权利要求1所述的基于无线通信的固态纳米孔基因测序数据通信方法,其特征在于,所述步骤4中的算法模块是深度学习的碱基识别算法或者是序列比对算法。
3.根据权利要求1所述的基于无线通信的固态纳米孔基因测序数据通信方法,其特征在于,步骤3中数据通信方案具体包括以下步骤:
步骤3.1、设置通信资源总量为Q,将用户分为五类,分别建立用户集合其中为普通用户集合,为疑似病例用户集合,为密切接触者用户集合,为通信装置本地内存占用已达极限的用户的集合,为VIP用户集合;其中,i,j表示用户编号,表示空集;设置五个集合的用户总数分别为:N1、N2、N3、N4、N5,为五类用户分别设置资源分配权重w1、w2、w3、w4、w5;其中,资源分配权重会随着用户总数、各集合用户数的变化而变化,但总是保证w1<w5<w4<w3<w2,非同类用户的资源分配权重不同,同类用户的资源分配权重相同;
步骤3.2、初始化用户集合,其中
步骤3.3、为各用户分配通信资源,其中,分配给用户k的通信资源Qk为
其中,k表示用户编号,∈表示属于;
若用户集合改变,则w1、w2、w3、w4、w5随之改变,Qk依据上式改变。即通信资源分配是动态调整的。
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