[发明专利]一种基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法在审
申请号: | 202210123897.1 | 申请日: | 2022-02-10 |
公开(公告)号: | CN114511540A | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 王平;张晨滨;颜鲲;马萌;刘德风;和清源 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06V10/26;G06V10/80;G06V10/82;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 | 代理人: | 贾晓玲 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 多模态 mri 图像 肌肉 分割 模型 方法 | ||
1.一种基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,具体步骤包括:
A.遍历整个数据集的每一张MRI图像,解析MRI图像的物理信息;
B.采用两个结构一致参数不共享的编码器分别编码一对MRI图像,它们分别来自FAT模态和WATER模态,得到两个模态的多个中间特征;
C.采用注意力机制子模块拼接上述两个模态的中间特征,得到整合后的多模态特征;
D.通过解码器生成肌肉分割的结果,将该结果和真实标注进行比对,通过反向传播的方式训练模型,得到训练好的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型。
2.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,步骤A具体为:
1)遍历整个数据集的每一张MRI图像Ii,解析图像中的层厚信息(di,hi,wi),这里di,hi,wi分别表示图中每个体素的物理深度、高度和宽度;
2)计算出数据集的平均层厚将所有的MRI图像都放缩到该层厚;
3)遍历每张放缩后的MRI图像I′i,解析分辨率信息(Di,Hi,Wi),其中Di,Hi,Wi分别是图像的深度、高度和宽度;
4)根据每张图像的分辨率信息计算出最大的分辨率并将每张MRI图像填充至该分辨率。
3.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,步骤B具体为:
编码器一,编码来自FAT模态的MRI图像,其中输入MRI图像首先经过卷积子模块1.1,得到中间特征1;再对中间特征1经过池化层做降采样,输入到卷积子模块1.2,得到中间特征2;以此类推得到多个中间特征;
编码器二,编码来自WATER模态的MRI图像,编码过程与编码器一相同。
4.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,步骤C中注意力机制子模块具体操作为:
1)使用一个3D卷积层计算出两个模态的相对权重;
2)在特征的每个空间位置,从权重数组对应位置读出当前位置两个模态的相对权重w1和w2,从两个模态分别读出当前位置的特征向量1和特征向量2,按照权重对两个特征向量加权求和得到新的特征向量。
5.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,编码器包含多个层叠的池化层和卷积子模块,卷积子模块以原始图像数据或上一个卷积子模块的输出为输入,得到中间特征。
6.如权利要求5所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,卷积子模块包括多个卷积层和非线性层,图像数据会先经过卷积层,得到数组形状不变的特征,然后再用非线性层把特征中的所有负数置0,得到输出的中间特征。
7.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,解码器由交替的卷积子模块和上采样层所构成,从底层特征开始,逐步用上采样层解析特征的空间维度,采用卷积子模块融合多层特征,最终输出肌肉的分割结果。
8.如权利要求1所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,步骤D中计算得到损失函数:
其中,表示预测的分割结果在位置(i,j,k)的取值,表示金标准人工标注结果在位置(i,j,k)的取值,δ(x,y)是一个判断函数,当x和y数值一致时,δ(x,y)取值为1,否则为0;该损失函数衡量了模型分割结果和真实标注结果之间的一致程度,两者一致程度越高,该损失函数的取值低,模型的训练目标就是最小化该损失函数的值。
9.如权利要求8所述的基于多模态MRI图像的肌肉分割模型方法,其特征在于,模型的训练方式是从损失函数开始,回传梯度至两个编码器、注意力机制模块和解码器当中的每个参数,再让每个参数根据其对应的梯度更新。
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