[发明专利]基于唾液微生物的甲状腺癌分子标志物及其应用有效
申请号: | 202210078774.0 | 申请日: | 2022-01-24 |
公开(公告)号: | CN114410730B | 公开(公告)日: | 2022-09-30 |
发明(设计)人: | 严江伟;李万婷;程凤;张君;刘海燕;李彩红;张晓梦;漆小琴 | 申请(专利权)人: | 山西医科大学 |
主分类号: | C12Q1/14 | 分类号: | C12Q1/14;C12Q1/06;C12Q1/689;C12N15/11;G16H50/30 |
代理公司: | 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 | 代理人: | 陈伟 |
地址: | 030001 *** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 唾液 微生物 甲状腺癌 分子 标志 及其 应用 | ||
1.检测微生物分子标志物丰度的试剂在制备甲状腺癌检测工具中的应用,其特征在于:所述的微生物分子标志物包括普氏菌属Prevotella_7、卟啉单胞菌属Porphyromonas、乳酸杆菌目Lactobacillales、拟普雷沃菌属Alloprevotella、月形单胞菌属Selenomonas_3、丛毛单胞菌属Comamonas、梭形杆菌属Fusobacterium、罗氏菌属Rothia、棒状杆菌属Corynebacterium、弯曲杆菌属Campylobacter、链球菌属Streptococcus、孪生球菌属Gemella、瘤胃球菌属Ruminococcaceae_UCG-014、纤毛菌属Leptotrichia和嗜血杆菌属Haemophilus;所述的甲状腺癌的风险通过菌属相对丰度计算得到,计算公式如下:
模型的公式一如下:
Z=2.4905400-0.8970850X1+4.8303135X2-0.3630332X3-1.6945272X4+0.2513430X5+0.3843337X6-0.4107600X7+0.4504628X8-0.7942644X9-0.2010625X10-0.3727216X11-0.2103645X12-1.2745899X13+0.9434769X14+1.3181818X15;
其中,X1、X2、X3…至X15分别表示菌属Fusobacterium、Prevotella_7、Rothia、Corynebacterium、Porphyromonas、Lactobacillales、Haemophilus、Alloprevotella、Campylobacter、Streptococcus、Gemella、Ruminococcaceae_UCG-014、Leptotrichia、Selenomonas_3、Comamonas的相对丰度;
模型的公式二如下:
将公式一计算得到的Z值代入公式二,e表示自然常数,-z为自然常数的指数,求出y值,若y>0.5,预测为甲状腺癌患者,若y≤0.5,预测为健康对照者。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的普氏菌属Prevotella_7、卟啉单胞菌属Porphyromonas、乳酸杆菌目Lactobacillales、拟普雷沃菌属Alloprevotella、月形单胞菌属Selenomonas_3、丛毛单胞菌属Comamonas相对丰度显著升高;所述的梭形杆菌属Fusobacterium、罗氏菌属Rothia、棒状杆菌属Corynebacterium、弯曲杆菌属Campylobacter、链球菌属Streptococcus、孪生球菌属Gemella、瘤胃球菌属Ruminococcaceae_UCG-014、纤毛菌属Leptotrichia和嗜血杆菌属Haemophilus相对丰度显著降低。
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