[发明专利]一种与梅花鹿茸重性状相关的SNP分子标记及其检测引物、试剂盒和应用

说明书

本发明提供了一种与梅花鹿茸重性状相关的SNP分子标记及其检测引物、试剂盒和应用，涉及分子遗传学技术领域。所述SNP分子标记位于MSRB3基因上，在g.44455582位存在T/C碱基突变，该位点多态性与梅花鹿茸重性状具有显著相关性。本发明可利用对所述SNP位点的检测实现对梅花鹿的早期预测和筛选，可将高茸重与低茸重梅花鹿区分开来，可实现帮助选育高鹿茸产量的梅花鹿。

技术领域

本发明涉及分子遗传学技术领域，尤其是涉及一种与梅花鹿茸重性状相关的SNP分子标记及其检测引物、试剂盒和应用。

背景技术

甲硫氨酸亚砜还原酶B3(methionine sulfoxide reductase B3,MSRB3)基因是MSRB基因家族成员，是一种氧化还原酶，可特异性催化R-甲硫氨酸亚砜还原为甲硫氨酸(Kwak GH等，2017)。MSRB3是一种多效基因，在人体中可编码MSRB3A和MSRB3B两种类型的蛋白，前者位于内质网，后者位于线粒体(Kim HY等，2004)。MSRB3在衰老和应激耐受中起着关键作用，过表达人MSRB3基因的果蝇家系表现出更长的寿命，也提高了其对氧化、冷和热应激的抵抗力(D.H.Lim等，2012以及G.H.Kwak等2012)。MSRB3基因通过p53-p21和p27途径调节细胞生长，敲除该基因抑制小鼠胚胎成纤维细胞和人真皮成纤维细胞的增殖(Lee E等，2014)。

此外，MSRB3基因还可影响耳朵的形状和大小、听觉系统、海马体的大小。在关于畜禽的研究中，主要集中于MSRB3基因影响耳型性状。GWAS结果表明MSRB3基因参与牛骨化和脂肪组织发育过程的调节。WU等发现MSRB3基因存在3个插入缺失(insertions anddeletions,indels)标记与我国黄牛生长性状显著相关。目前该基因与梅花鹿相关性状研究较少。

梅花鹿是最有价值的药用动物之一，其全身是宝，而以鹿茸最具盛名。鹿茸具有增强免疫力、改善性功能、抵抗衰老等作用，在中医临床方面起重要作用(杨洁等，2021；Sui Z等，2014)。因其较高的药用价值和经济价值，鹿茸产量受到了极大的关注。随着分子生物技术的发展，相关性状的分子标记已广泛应用于畜禽的遗传改良中，极大提高了育种效率，缩短育种周期。因此，有必要继续研究和开发与鹿茸产量性状相关的分子标记。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与梅花鹿茸重性状相关的SNP分子标记及其检测引物、试剂盒和应用。本发明发现MSRB3基因上的一个SNP位点基因多态性与梅花鹿茸重性状具有显著相关性。本发明可利用对所述SNP位点的检测实现对梅花鹿的早期预测和筛选，可将高茸重与低茸重梅花鹿区分开来，可实现帮助选育高鹿茸产量的梅花鹿。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

在第一方面，本发明提供了一种与梅花鹿茸重性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于MSRB3基因上，在g.44455582位存在T/C碱基突变。

本发明以梅花鹿为研究对象，应用直接测序法检测MSRB3基因的多态性，通过SNP分型技术分析基因型，并与鲜茸重性状进行关联分析。在g.44455582位存在TC碱基突变，应用于筛选具有高茸重的梅花鹿，为梅花鹿鲜茸重性状的选择提供了新的分子标记基础。

在第二方面，本发明提供了一种用于检测或预测梅花鹿茸重性状的引物，所述引物为用于扩增前述SNP分子标记的引物组合；

优选地，所述引物组合包括PCR扩增引物和延伸引物，所述PCR扩增引物的核苷酸序列如SEQ ID No.22和SEQ ID No.23所示；所述延伸引物的核苷酸序列如SEQ ID No.24所示。