[发明专利]绵羊血液基因组DNA的提取方法及其应用、绵羊资源群体的遗传多样性评价方法在审
申请号: | 202210069549.0 | 申请日: | 2018-04-23 |
公开(公告)号: | CN114181934A | 公开(公告)日: | 2022-03-15 |
发明(设计)人: | 周明亮;杨平贵;庞倩;陈明华;蒋世海 | 申请(专利权)人: | 四川省草原科学研究院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/686;C12Q1/6888 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 戴嵩玮 |
地址: | 624000 四川省阿坝藏族*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 绵羊 血液 基因组 dna 提取 方法 及其 应用 资源 群体 遗传 多样性 评价 | ||
1.一种提取绵羊血液基因组DNA的方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)取绵羊血液200μL,加入到1.5mL的EP管中,加入20μL的蛋白酶K溶液后混匀,再加入200μL缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃水浴锅中放置10min;
2)取出EP管,再加入200μL无水乙醇,充分振荡混匀15s,将所得溶液转移至吸附柱CB3中,12000rpm离心30s,倒掉收集管中废液,向吸附柱CB3加入500μL的GD,12000rpm离心30s,倒掉收集管中废液;
3)向吸附柱CB3加入600μL的漂洗液PW,12000rpm离心30s,倒掉收集管中废液,重复一次向吸附柱CB3中加600μL的漂洗液PW、离心及倒掉废液;
4)将吸附柱CB3放回收集管中,12000rpm离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温数分钟,再转入一个新的EP管中,向吸附柱的中间部位悬空滴加洗脱缓冲液TE,室温放置2~5min,12000rpm离心2min,EP管中的液体即为提取的DNA溶液,进行凝胶电泳检测后置于-20℃环境下保存备用。
2.权利要求1所述方法得到的绵羊血液基因组DNA在评价绵羊资源群体的遗传多样性中的应用。
3.一种绵羊资源群体的遗传多样性评价方法,其特征在于:包括以下步骤:
采集绵羊的血液样品;
利用权利要求1所述的方法提取血液样品的基因组DNA;
在微卫星标记数据库中筛选30对微卫星标记引物,分布于绵羊26对常染色体和X性染色体,并通过NCBI数据库验证引物序列,微卫星标记采用5-ROX、5'6-FAM(FITC)、5-TAMRA和5-HEX进行荧光标记;
PCR扩增及微卫星标记的等位基因分型;
统计分析及资源群体的遗传多样性评价,采用软件分析微卫星标记的杂合度和多态信息含量,按照衡量基因变异程度高低的多态信息含量指标,即PIC0.50的标记为高度多态信息位点,PIC0.25的标记为低度多态信息位点,0.25<P<0.50的标记为中度多态信息位点,绵羊群体30个微卫星标记的遗传多态信息含量为0.3338~0.8660,其中7个标记为中度多态信息位点,23个标记为高度多态信息位点,群体的平均多态信息含量为0.6257,来表明绵羊资源群体具有丰富的遗传多态性。
4.根据权利要求3所述的绵羊资源群体的遗传多样性评价方法,其特征在于:所述采集步骤为:采用颈静脉采布拖黑绵羊的血3~4mL,注入加有抗凝剂肝素钠的一次性真空采血管中,随后将采血管180°颠倒混匀5-6次,置于低温保存箱中运输,带回实验室20°保存备用。
5.根据权利要求3所述的绵羊资源群体的遗传多样性评价方法,其特征在于:所述PCR扩增及等位基因分型的步骤为:使用试剂盒,25μL反应体系:2×Taq PCR MasterMix 12.5μL,上、下游引物10mmol/L各1μL,DNA模板1μL,用超纯水补充至25μL,94℃预变性5min,94℃变性30s,56℃-63℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环,最后72℃延伸8min,扩增产物8℃保存。
6.根据权利要求3所述的绵羊资源群体的遗传多样性评价方法,其特征在于:所述软件为Cervus3.0软件。
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