[发明专利]地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法在审
申请号: | 202210019954.1 | 申请日: | 2022-01-10 |
公开(公告)号: | CN114354946A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 宫海燕;何丽娟;赵智龙 | 申请(专利权)人: | 新疆医科大学第五附属医院 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;G16B40/30 |
代理公司: | 北京鼎佳达知识产权代理事务所(普通合伙) 11348 | 代理人: | 孟阿妮;张小勇 |
地址: | 830000 新疆维吾尔*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 地域性 病原菌 多肽 质量 参考 建立 方法 | ||
本发明为地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法。地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法,包括以下步骤:(1)收集本地常见的人源病原菌;(2)采集所述的人源病原菌进行蛋白质指纹图谱;(3)分析所述的人源病原菌蛋白质指纹图谱,并收集特征性图谱后,建立人源病原菌的地域性特征图谱数据库,即所述的人源病原菌多肽质量参考谱库。本发明所述的人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法,构建的金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和鲍曼不动杆菌的本地PMRSL数据库,符合质谱检测鉴定要求,可用于本地人源病原菌金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和鲍曼不动杆菌的鉴定,同时扩充原始参考数据库,提高数据库鉴定的准确率和完整度。
技术领域
本发明具体涉及地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法。
背景技术
病原菌感染的发生发展对人类健康构成了严重的威胁,耐药菌的治疗对人类的生命提出了严峻的挑战,我区地处西北是多民族聚居的地方,病原菌的感染和流行特点等与内地存在一定的差异。
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorptionionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术对微生物的种属鉴定具有快速、准确、低成本的优势,该技术是将仪器采集的未知样品的多肽质量图谱与数据库中已知菌种的图谱进行聚类分析,获得鉴定结果。因此,菌种鉴定准确性和特异性依赖于MALDI-TOF MS生产商或用户预先制定的微生物MALDI-TOF MS图谱数据库的完整性和可靠性,即数据库是MALDI-TOF MS鉴定微生物的核心。目前,仍缺乏针对将某一国家或地区的大量致病微生物用于系统分析的研究,即我国并未建立不同地区不同病原菌的鉴定数据库。
有鉴于此,本发明提出地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法,可用于本地人源病原菌金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和鲍曼不动杆菌的快速、准确鉴定。
发明内容
本发明的目的在于提供人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法,构建的金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和鲍曼不动杆菌的本地PMRSL数据库,符合质谱检测鉴定要求,可用于本地常见病原菌金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和鲍曼不动杆菌的鉴定,同时扩充原始参考数据库(Original Reference Database,ORD),提高数据库鉴定的准确率和完整度。
为了实现上述目的,所采用的技术方案为:
地域性人源病原菌多肽质量参考谱库的建立方法,包括以下步骤:
(1)收集本地常见的人源病原菌;
(2)采集所述的人源病原菌进行蛋白质指纹图谱;
(3)分析所述的人源病原菌蛋白质指纹图谱,并收集特征性图谱后,建立人源病原菌的地域性特征图谱数据库,即所述的人源病原菌多肽质量参考谱库。
进一步的,所述的步骤(1)中,通过16S rRNA测序鉴定临床分离筛选的人源病原菌。
进一步的,所述的步骤(1)中,常见的人源病原菌为金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌。
进一步的,所述的步骤(3)中,通过MicroID检测系统,分析所述的人源病原菌蛋白质指纹图谱特征性数据。
进一步的,所述的建立方法还包括步骤(4),用标准菌株和大量人类同种病原菌对其进行验证。
与现有技术相比,本发明的有益效果在于:
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