[发明专利]信息处理方法、信息处理装置以及信息处理程序

说明书

本发明提供一种信息处理方法、信息处理装置以及信息处理程序。信息处理装置(1)具备：获取部(121)，获取基因数据，该基因数据由基因检测设备检测，包括表示用户的基因型的碱基序列；区域确定部(122)，在参照数据中确定基因数据所位于的区域；稀有度计算部(123)，基于与确定出的区域建立了关联的数据密度，计算表示基因数据的稀有性的稀有度；奖励计算部(125)，根据计算出的稀有度，计算向用户赋予的奖励；输出部(126)，输出计算出的奖励。

技术领域

本公开涉及收集基因数据的技术。

背景技术

近年来，已知对不能由SNP(single nucleotide polymorphism，单核苷酸多态性)微阵列获取的区域的遗传类型进行推定的被称为SNP基因型填充的技术。在SNP基因型填充中，使用高密度地搭载有表示SNP的基因型的信息的参照数据。为了构建高密度的参照数据，要求高效地收集数据密度低的区域的基因数据、即高效地收集具有稀有性的基因数据，而不是随意地收集基因数据。

在专利文献1中公开了一种生命信息数据提供方法，利用区块链技术来使生命信息数据的泄露以及基因组数据的伪造或窜改困难。

在专利文献2中公开了一种信息交易装置，在向信息提供者提示了报酬金额的基础上，仅将获得了同意的信息提供者所对应的用户信息提供给信息利用者，并根据用户信息的获取状况调整报酬金额。

然而，上述的以往技术均完全未考虑高效地收集具有稀有性的基因数据，需要进一步的改善。

在先技术文献

专利文献

专利文献1：日本专利第6661742号公报

专利文献2：日本专利第5978198号公报

发明内容

本公开是为了解决上述课题而完成的，其目的在于，提供能够高效地收集具有稀有性的基因数据的技术。

本公开的一方式涉及的信息处理方法是使用参照数据来进行信息处理的信息处理装置中的信息处理方法，所述参照数据是对表示基因组的基因型的碱基序列和与所述碱基序列的位点相应的数据密度预先建立了关联的数据，在所述信息处理方法中，获取基因数据，该基因数据由基因检测设备检测，包括表示用户的基因型的碱基序列，确定在所述参照数据中所述基因数据所位于的区域，基于与确定出的所述区域建立了关联的数据密度，计算表示所述基因数据的稀有性的稀有度，根据计算出的所述稀有度计算向所述用户赋予的奖励，输出计算出的所述奖励。

根据本公开，能够高效地收集具有稀有性的基因数据。

附图说明

图1是示出应用了本公开的实施方式1中的信息处理装置的信息处理系统的整体结构的一个例子的图。

图2是示出图1所示的信息处理装置的结构的一个例子的框图。

图3是关于基因解析的术语的说明图。

图4是示出参照数据的数据结构的一个例子的图。

图5是根据数据密度展示参照数据的图。

图6是示出本公开的实施方式1中的信息处理装置的处理的一个例子的流程图。

图7是示出本公开的实施方式2中的信息处理装置的结构的一个例子的框图。

图8是示出地域参照数据的数据结构的一个例子的图。

图9是根据数据密度展示图8所示的地域参照数据的图。

图10是示出本公开的实施方式2中的信息处理装置的处理的一个例子的流程图。

具体实施方式

(实现本公开的经过)