[发明专利]用于标记核酸的方法在审
申请号: | 202180069399.7 | 申请日: | 2021-09-14 |
公开(公告)号: | CN116323603A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 曼纽尔·纳皮;亚历山大·霍弗;尚卡尔·巴拉苏布拉马尼安;马修·J·冈特 | 申请(专利权)人: | 剑桥实业有限公司 |
主分类号: | C07D417/12 | 分类号: | C07D417/12 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 张晓影 |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 标记 核酸 方法 | ||
1.一种用于标记包含N6-甲基腺嘌呤(N6mAde)的核酸的方法,所述方法包括:
i)在N6mAde的N6-甲基基团上形成α-氨基自由基;和
ii)用包含亚硝基吡啶基基团(O=N-Py-)的自由基受体捕获所述α-氨基自由基。
2.根据权利要求1所述的方法,其中通过将包含N6mAde的所述核酸与以胺为中心的自由基阳离子接触以从N6mAde的所述N6-甲基基团提出氢原子来形成所述α-氨基自由基。
3.根据权利要求2所述的方法,包括氧化胺以产生所述以胺为中心的自由基阳离子。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述胺为叔胺,例如具有下式的奎宁环:
其中,R选自氢原子、羟基、C1-6烷基、C1-6烷氧基、C1-6酰氧基、C1-6反酯基或者基团-C(OH)R1R2(其中R1和R2选自C1-6烷基)。
5.根据权利要求3或4中任一项所述的方法,其中将光催化剂用于氧化所述胺,任选地其中处于激发态或还原形式的所述光催化剂具有相对于SCE至少+1.10V至相对于SCE至多+1.45V的还原电势。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述光催化剂是过渡金属光催化剂,例如钌或铱光催化剂,任选地其中所述光催化剂选自[Ru(phen)3]2+和[Ru(bpz)3]2+。
7.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述自由基受体是具有式(I)的探针:
O=N-Py-L-X (I)
其中-Py-是吡啶二基基团,-L-是接头且-X是标记。
8.根据权利要求7所述的方法,其中-L-是:
-L1-L2-L3-
其中:
-L1-选自共价键或者C6-10亚芳基;
-L2-选自酰胺键、酯键、羰基键、胺键或者醚键;且
-L3-选自C1-10亚烷基和C1-10亚杂烷基。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其中-X为点击反应配偶体(-C1),例如选自下列的基团:C2-20炔基、C2-20烯基、异氰基、叠氮基、硝酮、氧化腈和四嗪,优选地其中-C1为C2-20炔基,例如乙炔基。
10.根据权利要求8或9所述的方法,其中由具有式(II)的前体原位形成所述探针:
O2N-Py-L-X (II)
其中-Py-是吡啶二基基团,-L-是接头且-X是标记。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述前体选自式P1至P7的化合物:
12.根据权利要求10或11所述的方法,其中通过还原所述式(II)的前体形成所述探针。
13.根据权利要求12所述的方法,其中将光催化剂用于还原所述式(II)的前体,例如其中将相同光催化剂用于还原所述式(II)的前体以及氧化胺以产生以胺为中心的自由基阳离子。
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